Hintergrundinformationen zur NIEHS-Studie
Der NIEHS-Datensatz (Endpunkt C) wurde vom National Institute of Environmental Health Sciences (NIEHS) der National Institutes of Health (Research Triangle Park, NC, USA) bereitgestellt. Ziel der Studie war die Verwendung von Microarray-Genexpressionsdaten aus der Leber von Ratten, die Hepatotoxinen ausgesetzt waren, um Klassifikatoren für die Vorhersage von Lebernekrose zu erstellen. Der Genexpressionsdatensatz „Kompendium“ wurde von 418 Ratten gesammelt, die einer von acht Verbindungen (1,2-Dichlorbenzol, 1,4-Dichlorbenzol, Brombenzol, Monocrotalin, N-Nitrosomorpholin, Thioacetamid, Galactosamin und Diquatdibromid) ausgesetzt waren. Alle acht Verbindungen wurden mithilfe standardisierter Verfahren untersucht, dh einer gemeinsamen Array-Plattform (Affymetrix Rat 230 2.0 Microarray), experimentellen Verfahren sowie Datenabruf- und Analyseprozessen. Kurz gesagt, für jede Verbindung wurden vier bis sechs männliche, 12 Wochen alte F344-Ratten einer niedrigen Dosis, einer mittleren Dosis(en) und einer hohen Dosis des Giftstoffs ausgesetzt und 6, 24 und 48 Stunden später getötet. Bei der Autopsie wurde Leber für die RNA-Extraktion, histopathologische und klinisch-chemische Beurteilung entnommen.
MAQC-II-Projekt
NIEHS-Studie
Daten hier herunterladen (GSE16716-GPL1355_series_matrix.txt.gz 35 MB)
