Informations générales sur l'étude NIEHS
L'ensemble de données NIEHS (endpoint C) a été fourni par le National Institute of Environmental Health Sciences (NIEHS) des National Institutes of Health (Research Triangle Park, NC, USA). L'objectif de l'étude était d'utiliser les données d'expression génique des puces à ADN acquises à partir du foie de rats exposés à des hépatotoxines pour construire des classificateurs pour la prédiction de la nécrose hépatique. L'ensemble de données du « compendium » sur l'expression génique a été recueilli auprès de 418 rats exposés à l'un des huit composés (1,2-dichlorobenzène, 1,4-dichlorobenzène, bromobenzène, monocrotaline, N-nitrosomorpholine, thioacétamide, galactosamine et dibromure de diquat). Les huit composés ont été étudiés à l'aide de procédures standardisées, c'est-à-dire une plate-forme de puce commune (micropuce Affymetrix Rat 230 2.0), des procédures expérimentales et des processus de récupération et d'analyse des données. En bref, pour chaque composé, quatre à six rats F344 mâles âgés de 12 semaines ont été exposés à une faible dose, à une ou plusieurs doses moyennes et à une dose élevée du toxique et ont été sacrifiés 6, 24 et 48 heures plus tard. À l'autopsie, le foie a été prélevé pour l'extraction de l'ARN, l'histopathologie et les évaluations de chimie clinique.
Projet MAQC-II
Étude NIEHS
Téléchargez les données ici (GSE16716-GPL1355_series_matrix.txt.gz 35 Mo)