Hintergrundinformationen zur NIEHS-Studie
Der NIEHS-Datensatz (Endpunkt C) wurde vom National Institute of Environmental Health Sciences (NIEHS) der National Institutes of Health (Research Triangle Park, NC, USA) bereitgestellt. Das Studienziel war die Verwendung von Microarray-Genexpressionsdaten, die aus der Leber von Ratten gewonnen wurden, die Hepatotoxika ausgesetzt waren, um Klassifikatoren für die Vorhersage von Lebernekrose zu erstellen. Der „Kompendium“-Datensatz der Genexpression wurde von 418 Ratten gesammelt, die einer von acht Verbindungen (1,2-Dichlorbenzol, 1,4-Dichlorbenzol, Brombenzol, Monocrotalin, N-Nitrosomorpholin, Thioacetamid, Galactosamin und Diquatdibromid) ausgesetzt waren. Alle acht Verbindungen wurden unter Verwendung standardisierter Verfahren untersucht, dh einer gemeinsamen Array-Plattform (Affymetrix Rat 230 2.0 Microarray), experimenteller Verfahren und Datenabruf- und Analyseverfahren. Kurz gesagt wurden für jede Verbindung vier bis sechs männliche, 12 Wochen alte F344-Ratten einer niedrigen Dosis, mittleren Dosis(en) und einer hohen Dosis des Giftstoffs ausgesetzt und 6, 24 und 48 Stunden später getötet. Bei der Nekropsie wurde die Leber zur RNA-Extraktion, histopathologischen und klinisch-chemischen Beurteilung entnommen.
MAQC-II-Projekt
NIEHS-Studie
Daten hier herunterladen (GSE16716-GPL1355_series_matrix.txt.gz 35 MB)
