D75 mRNA 発現データを用いた肝毒素暴露ラットの肝壊死研究NIEHS研究の背景情報
NIEHS データ セット (エンドポイント C) は、国立衛生研究所 (リサーチ トライアングル パーク、ノースカロライナ州、米国) の国立環境衛生科学研究所 (NIEHS) によって提供されました。 研究の目的は、肝毒素に曝露されたラットの肝臓から得られたマイクロアレイ遺伝子発現データを使用して、肝壊死の予測のための分類子を構築することでした。 遺伝子発現「大要」データセットは、8 つの化合物 (1,2-ジクロロベンゼン、1,4-ジクロロベンゼン、ブロモベンゼン、モノクロタリン、N-ニトロソモルホリン、チオアセトアミド、ガラクトサミン、ジクアット ジブロマイド) のいずれかに暴露された 418 匹のラットから収集されました。 標準化された手順、すなわち共通のアレイ プラットフォーム (Affymetrix Rat 230 2.0 マイクロアレイ)、実験手順、およびデータの取得と分析プロセスを使用して、8 つの化合物すべてを調べました。 簡単に説明すると、各化合物について、4 ～ 6 匹の雄の 12 週齢の F344 ラットを低用量、中用量、および高用量の毒性物質に暴露し、6、24、および 48 時間後に屠殺しました。 剖検時に、RNA 抽出、組織病理学、および臨床化学評価のために肝臓を採取しました。
MAQC-Ⅱプロジェクト
NIEHS研究
データのダウンロードはこちら (GSE16716-GPL1355_series_matrix.txt.gz 35MB)
ケーススタディデータ表JMPゲノミクス
