D75 用基因表达数据对暴露于肝毒物的大鼠进行肝坏死研究NIEHS 研究背景信息
NIEHS 数据集(端点 C)由美国国立卫生研究院(美国北卡罗来纳州三角研究园)的国家环境健康科学研究所 (NIEHS) 提供。 研究目的是使用从暴露于肝毒物的大鼠肝脏中获得的微阵列基因表达数据来构建预测肝坏死的分类器。 从暴露于八种化合物(1,2-二氯苯、1,4-二氯苯、溴苯、野百合碱、N-亚硝基吗啉、硫代乙酰胺、半乳糖胺和敌草快二溴化物)中的一种的 418 只大鼠中收集基因表达“纲要”数据集。 所有八种化合物均使用标准化程序进行研究,即通用阵列平台(Affymetrix Rat 230 2.0 微阵列)、实验程序以及数据检索和分析过程。 简而言之,对于每种化合物,将四到六只雄性、12周龄的F344大鼠暴露于低剂量、中剂量和高剂量的毒物,并在6、24和48小时后处死。 在尸检时,收集肝脏用于 RNA 提取、组织病理学和临床化学评估。
MAQC-II项目
NIEHS研究
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实例探究数据表JMP基因组学