Informazioni di base sullo studio del NIEHS
Il set di dati NIEHS (endpoint C) è stato fornito dal National Institute of Environmental Health Sciences (NIEHS) del National Institutes of Health (Research Triangle Park, NC, USA). L'obiettivo dello studio era di utilizzare i dati di espressione genica di microarray acquisiti dal fegato di ratti esposti a epatotossici per costruire classificatori per la previsione della necrosi epatica. Il set di dati "compendio" dell'espressione genica è stato raccolto da 418 ratti esposti a uno degli otto composti (1,2-diclorobenzene, 1,4-diclorobenzene, bromobenzene, monocrotalina, N-nitrosomorfolina, tioacetamide, galattosammina e diquat dibromuro). Tutti gli otto composti sono stati studiati utilizzando procedure standardizzate, ovvero una piattaforma array comune (Affymetrix Rat 230 2.0 microarray), procedure sperimentali e processi di recupero e analisi dei dati. In breve, per ciascun composto, da quattro a sei ratti maschi F344 di 12 settimane di età sono stati esposti a una dose bassa, una dose media e una dose alta del tossico e sono stati sacrificati a 6, 24 e 48 ore dopo. All'autopsia, il fegato è stato raccolto per l'estrazione dell'RNA, l'istopatologia e le valutazioni di chimica clinica.
Progetto MAQC-II
Studio NIEHS
Scarica i dati qui (GSE16716-GPL1355_series_matrix.txt.gz 35 MB)
