遺伝子発現データを用いた肝毒性物質に曝露されたラットのD75肝臓壊死研究NIEHS研究の背景情報
NIEHSデータセット(エンドポイントC)は、国立衛生研究所(米国ノースカロライナ州リサーチトライアングルパーク)の国立環境衛生科学研究所(NIEHS)によって提供されました。 研究の目的は、肝毒性物質に曝露されたラットの肝臓から取得したマイクロアレイ遺伝子発現データを使用して、肝臓壊死を予測するための分類子を構築することでした。 遺伝子発現「大要」データセットは、8つの化合物(1,2-ジクロロベンゼン、1,4-ジクロロベンゼン、ブロモベンゼン、モノクロタリン、N-ニトロソモルホリン、チオアセトアミド、ガラクトサミン、および二臭化ジクワット)の1つに曝露された418匹のラットから収集されました。 8つの化合物はすべて、標準化された手順、つまり共通アレイプラットフォーム(Affymetrix Rat 230 2.0マイクロアレイ)、実験手順、データ検索および分析プロセスを使用して研究されました。 簡単に説明すると、各化合物について、4〜6匹の雄、12週齢のF344ラットを低用量、中用量、高用量の毒物に曝露し、6、24、48時間後に屠殺した。 剖検時に、RNA抽出、組織病理学、および臨床化学評価のために肝臓を採取しました。
MAQC-IIプロジェクト
NIEHS研究
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ケーススタディデータテーブルJMPゲノミクス