D72 mRNA発現を有する雄のSprague-Dawleyラットにおける肝臓腫瘍の研究Iconix 研究の背景情報
Iconix データセット (エンドポイント 
は、Iconix Biosciences, Inc. (米国カリフォルニア州マウンテンビュー) によって提供されました。 研究の目的は、非遺伝毒性化学物質による短期曝露による肝腫瘍誘発を評価することであった。これは、現在、非遺伝毒性肝腫瘍原物質を同定するための正確で十分に検証された短期試験が存在しないため、高価な2年間の試験が必要であるためである。リスク評価を開始する前にげっ歯類のバイオアッセイを行う必要があります。 このトレーニング セットは、構造的および機構的に多様な 76 種類の非遺伝毒性肝発がん性物質および非肝発がん性物質のうちの 1 つで 5 日間治療した 216 匹の雄 Sprague-Dawley ラットからの肝臓遺伝子発現データで構成されています。 検証セットは、構造的および機構的に多様な68種類の非遺伝毒性肝発がん性物質および非肝発がん性物質のうちの1つで5日間治療された201匹の雄Sprague-Dawleyラットで構成されています。 遺伝子発現データは、Amersham Codelink Uniset Rat 1 Bioarray (GE HealthCare、ニュージャージー州ピスカタウェイ) を使用して生成されました。 トレーニング セットと検証セットの分離は、マイクロアレイ データが収集された時間に基づいていました。つまり、研究の初期に処理されたマイクロアレイはトレーニングとして使用され、後で処理されたマイクロアレイは検証として使用されました。
MAQC-Ⅱプロジェクト
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ケーススタディデータ表JMPゲノミクス
