Informazioni di base sullo studio Iconix
Il set di dati Iconix (endpoint
è stato fornito da Iconix Biosciences, Inc. (Mountain View, CA, USA). L'obiettivo dello studio era valutare, in caso di esposizione a breve termine, l'induzione del tumore epatico da parte di sostanze chimiche non genotossiche, poiché attualmente non esistono test a breve termine accurati e ben validati per identificare i tumorigeni epatici non genotossici, rendendo quindi necessaria una costosa durata di 2 anni test biologico sui roditori prima che possa iniziare una valutazione del rischio. Il set di addestramento è costituito da dati di espressione genica epatica di 216 ratti maschi Sprague-Dawley trattati per 5 giorni con uno dei 76 epatocarcinogeni non genotossici e non epatocarcinogeni strutturalmente e meccanicamente diversi. Il set di convalida è costituito da 201 ratti maschi Sprague-Dawley trattati per 5 giorni con uno dei 68 epatocarcinogeni non genotossici e non epatocarcinogeni strutturalmente e meccanicamente diversi. I dati di espressione genica sono stati generati utilizzando l'Amersham Codelink Uniset Rat 1 Bioarray (GE HealthCare, Piscataway, NJ). La separazione del set di addestramento e del set di validazione era basata sul momento in cui sono stati raccolti i dati del microarray; cioè, i microarray elaborati in precedenza nello studio sono stati usati come addestramento e quelli elaborati successivamente sono stati usati come validazione.
Progetto MAQC II
Studio Iconix
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