遺伝子発現を伴うオスのSprague-Dawleyラットに関するD72肝腫瘍研究Iconix研究の背景情報
Iconixデータセット(エンドポイントB)は、Iconix Biosciences、Inc.(Mountain View、CA、USA)から提供されました。 研究の目的は、非遺伝子毒性の肝腫瘍を特定するための正確で十分に検証された短期試験が現在ないため、短期間の曝露時に非遺伝子毒性の化学物質による肝腫瘍の誘発を評価することでした。リスク評価を開始する前のげっ歯類のバイオアッセイ。 トレーニングセットは、76の構造的および機械的に多様な非遺伝子毒性肝発癌物質および非肝発癌物質の1つで5日間処理された216匹のオスのSprague-Dawleyラットからの肝遺伝子発現データで構成されています。 検証セットは、構造的および機械的に多様な68の非遺伝子毒性肝発癌物質および非肝発癌物質の1つで5日間処理された201匹の雄のSprague-Dawleyラットで構成されています。 遺伝子発現データは、Amersham Codelink Uniset Rat 1 Bioarray(GE HealthCare、ニュージャージー州ピスカタウェイ)を使用して生成されました。 トレーニングセットと検証セットの分離は、マイクロアレイデータが収集された時間に基づいていました。つまり、研究の初期に処理されたマイクロアレイはトレーニングとして使用され、後で処理されたマイクロアレイは検証として使用されました。
MAQC-IIプロジェクト
Iconix研究
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ケーススタディデータテーブル