Informazioni di base sullo studio Iconix
Il set di dati Iconix (endpoint 
è stato fornito da Iconix Biosciences, Inc. (Mountain View, CA, USA). L'obiettivo dello studio era di valutare, dopo un'esposizione a breve termine, l'induzione del tumore epatico da parte di sostanze chimiche non genotossiche, poiché attualmente non esistono test a breve termine accurati e ben convalidati per identificare tumorigeni epatici non genotossici, richiedendo così un costoso 2 anni test biologico sui roditori prima che possa iniziare una valutazione del rischio. Il set di addestramento è costituito da dati di espressione genica epatica da 216 ratti maschi Sprague-Dawley trattati per 5 giorni con uno dei 76 epatocarcinogeni non genotossici e non epatocarcinogeni strutturalmente e meccanicisticamente diversi. Il set di validazione è composto da 201 ratti maschi Sprague-Dawley trattati per 5 giorni con uno dei 68 epatocarcinogeni non genotossici e non epatocarcinogeni strutturalmente e meccanicisticamente diversi. I dati sull'espressione genica sono stati generati utilizzando l'Amersham Codelink Uniset Rat 1 Bioarray (GE HealthCare, Piscataway, NJ). La separazione del set di addestramento e del set di validazione è stata basata sul momento in cui sono stati raccolti i dati del microarray; vale a dire, i microarray elaborati in precedenza nello studio sono stati utilizzati come addestramento e quelli elaborati in seguito sono stati utilizzati come convalida.
Progetto MAQC-II
Studio Iconix
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