Hintergrundinformationen zur Iconix-Studie
Der Iconix-Datensatz (Endpunkt 
wurde von Iconix Biosciences, Inc. (Mountain View, CA, USA) bereitgestellt. Das Studienziel war die Bewertung der hepatischen Tumorinduktion durch nicht genotoxische Chemikalien bei kurzfristiger Exposition, da es derzeit keine genauen und gut validierten Kurzzeittests gibt, um nicht genotoxische hepatische Tumorigene zu identifizieren, was eine teure 2-Jahres-Exposition erfordert Nagetier-Bioassay, bevor eine Risikobewertung beginnen kann. Das Trainingsset besteht aus hepatischen Genexpressionsdaten von 216 männlichen Sprague-Dawley-Ratten, die 5 Tage lang mit einem von 76 strukturell und mechanistisch unterschiedlichen nicht genotoxischen Hepatocarcinogenen und Nicht-Hepatocarcinogenen behandelt wurden. Das Validierungsset besteht aus 201 männlichen Sprague-Dawley-Ratten, die 5 Tage lang mit einem von 68 strukturell und mechanistisch unterschiedlichen nicht genotoxischen Hepatokarzinogenen und Nicht-Hepatokarzinogenen behandelt wurden. Genexpressionsdaten wurden unter Verwendung des Amersham Codelink Uniset Rat 1 Bioarray (GE HealthCare, Piscataway, NJ) erzeugt. Die Trennung von Trainingsset und Validierungsset basierte auf dem Zeitpunkt der Erhebung der Microarray-Daten; dh früher in der Studie verarbeitete Microarrays wurden als Training verwendet und die später verarbeiteten wurden als Validierung verwendet.
MAQC-II-Projekt
Iconix-Studie
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