Hintergrundinformationen zur Hamner-Studie
Der Hamner-Datensatz (Endpunkt A) wurde von The Hamner Institutes for Health Sciences (Research Triangle Park, NC, USA) bereitgestellt. Das Studienziel war die Anwendung von Mikroarray-Genexpressionsdaten aus der Lunge weiblicher B6C3F1-Mäuse, die einer 13-wöchigen Behandlung mit Chemikalien ausgesetzt waren, um eine erhöhte Lungentumorinzidenz in den 2-jährigen Nagetierkrebs-Bioassays des National Toxicology Program vorherzusagen. Bei Erfolg können die Ergebnisse die Grundlage für einen effizienteren und wirtschaftlicheren Ansatz zur Bewertung der krebserzeugenden Aktivität von Chemikalien bilden. Die Microarray-Analyse wurde unter Verwendung von Affymetrix Mouse Genome 430 2.0-Arrays an drei bis vier Mäusen pro Behandlungsgruppe durchgeführt, und insgesamt 70 Mäuse wurden analysiert und als Trainingsset des MAQC-II verwendet. Zusätzliche Daten von einem anderen Satz von 88 Mäusen wurden später gesammelt und als externer Validierungssatz des MAQC-II bereitgestellt.
MAQC-II-Projekt
Hamner-Studie
Daten hier herunterladen (GSE16716-GPL1261_series_matrix.txt.gz 11MB)