Informazioni di base sullo studio Hamner
Il set di dati Hamner (endpoint A) è stato fornito dall'Hamner Institutes for Health Sciences (Research Triangle Park, NC, USA). L'obiettivo dello studio era applicare i dati di espressione genica dei microarray dal polmone di topi femmine B6C3F1 esposti a un trattamento di 13 settimane con sostanze chimiche per prevedere un aumento dell'incidenza del tumore polmonare nei test biologici di 2 anni sul cancro dei roditori del Programma nazionale di tossicologia. In caso di successo, i risultati potrebbero costituire la base di un approccio più efficiente ed economico per valutare l'attività cancerogena delle sostanze chimiche. L'analisi dei microarray è stata eseguita utilizzando gli array Affymetrix Mouse Genome 430 2.0 su tre o quattro topi per gruppo di trattamento e un totale di 70 topi sono stati analizzati e utilizzati come set di addestramento del MAQC-II. Ulteriori dati provenienti da un altro gruppo di 88 topi sono stati raccolti successivamente e forniti come set di validazione esterna del MAQC-II.
Progetto MAQC-II
Studio Hamner
Scarica i dati qui (GSE16716-GPL1261_series_matrix.txt.gz 11 MB)