유방암 연구 배경 정보
인간 유방암(BR) 데이터 세트(끝점 D 및 E)는 텍사스 대학교 MD 앤더슨 암 센터(MDACC, 휴스턴, 텍사스, 미국)에서 제공했습니다. 230개의 I-III 기 유방암의 유전자 발현 데이터는 치료 전 새로 진단된 유방암의 미세 바늘 흡인 표본에서 생성되었습니다. 생검 표본은 2000년에서 2008년 사이의 전향적 약물유전체 마커 발견 연구 중에 순차적으로 수집되었습니다. 이 표본은 간질 오염이 최소인 70-90% 순수 종양 세포를 나타냅니다. 환자들은 6개월간 파클리탁셀, 5-플루오로우라실, 시클로포스파미드 및 독소루비신을 포함하는 수술 전(신보조) 화학요법을 받은 후 암의 수술적 절제를 받았습니다. 수술 전 화학 요법에 대한 반응은 병리학적 완전 반응(pCR = 유방 또는 림프절에 잔류 침습성 암 없음) 또는 잔류 침습성 암(RD)으로 분류되었으며 예측을 위한 종점 D로 사용되었습니다. 종점 E는 면역조직화학에 의해 확립된 임상적 에스트로겐-수용체 상태이다. Affymetrix U133A 마이크로어레이를 사용하여 시간 경과에 따라 여러 배치에서 RNA 추출 및 유전자 발현 프로파일링을 수행했습니다. 이 순차적으로 발생한 환자 모집단의 하위 집합에 대한 게놈 분석은 이전에 보고되었습니다. 각 끝점에 대해 처음 130개의 사례는 훈련 세트로 사용되었고 다음 100개의 사례는 독립적인 검증 세트로 사용되었습니다.
MAQC-II 프로젝트
인간 유방암 연구
여기에서 데이터 다운로드(GSE16716-GPL96_series_matrix.txt.gz 17MB)
