D70 乳腺癌研究与 mRNA 表达数据乳腺癌研究背景资料
人类乳腺癌 (BR) 数据集（端点 D 和 E）由德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心（MDACC，美国德克萨斯州休斯顿）提供。 来自 230 个 I-III 期乳腺癌的基因表达数据是从任何治疗前新诊断的乳腺癌的细针穿刺标本中生成的。 活检标本是在 2000 年至 2008 年的前瞻性药物基因组学标志物发现研究期间按顺序收集的。 这些标本代表 70-90% 的纯肿瘤细胞，基质污染最少。 患者接受了 6 个月的术前（新辅助）化疗，包括紫杉醇、5-氟尿嘧啶、环磷酰胺和多柔比星，然后手术切除了癌症。 对术前化疗的反应被归类为病理完全反应（pCR = 乳腺或淋巴结中无残留浸润癌）或残留浸润癌 (RD)，并用作预测终点 D。 终点 E 是通过免疫组织化学确定的临床雌激素受体状态。 使用 Affymetrix U133A 微阵列随着时间的推移分多个批次进行 RNA 提取和基因表达谱分析。 先前报道了对这个连续累积的患者群体的一个子集的基因组分析。 对于每个端点，前 130 个案例用作训练集，接下来的 100 个案例用作独立验证集。
MAQC-II项目
人类乳腺癌研究
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实例探究数据表JMP 基因组学
