遺伝子発現データを伴うD70乳がん乳がん研究の背景情報
ヒト乳がん（BR）データセット（エンドポイントDおよびE）は、テキサス大学MDアンダーソンがんセンター（MDACC、米国テキサス州ヒューストン）から提供されました。 230のステージI-III乳がんの遺伝子発現データは、治療前に新たに診断された乳がんの穿刺吸引標本から生成されました。 生検標本は、2000年から2008年までの前向き薬理ゲノミクスマーカー発見研究中に順次収集されました。 これらの標本は、間質汚染が最小限の70〜90％純粋な腫瘍細胞を表しています。 患者は、パクリタキセル、5-フルオロウラシル、シクロホスファミド、ドキソルビシンを含む術前（ネオアジュバント）化学療法を6か月間受けた後、癌の外科的切除を受けました。 術前化学療法への反応は、病理学的完全反応（pCR =乳房またはリンパ節に残存浸潤癌なし）または残存浸潤癌（RD）として分類され、予測のエンドポイントDとして使用されました。 エンドポイントEは、免疫組織化学によって確立された臨床的なエストロゲン受容体の状態です。 RNA抽出と遺伝子発現プロファイリングは、AffymetrixU133Aマイクロアレイを使用して複数のバッチで経時的に実行されました。 この連続的に発生した患者集団のサブセットのゲノム分析は以前に報告されました。 各エンドポイントについて、最初の130ケースがトレーニングセットとして使用され、次の100ケースが独立した検証セットとして使用されました。
MAQC-IIプロジェクト
ヒト乳がん研究
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ケーススタディデータテーブル
