D70 乳腺癌研究與 mRNA 表達數據乳腺癌研究背景資料
人類乳腺癌 (BR) 數據集（端點 D 和 E）由德克薩斯大學 MD 安德森癌症中心（MDACC，美國德克薩斯州休斯頓）提供。 來自 230 個 I-III 期乳腺癌的基因表達數據是從任何治療前新診斷的乳腺癌的細針穿刺標本中生成的。 活檢標本是在 2000 年至 2008 年的前瞻性藥物基因組學標誌物發現研究期間按順序收集的。 這些標本代表 70-90% 的純腫瘤細胞，基質污染最少。 患者接受了 6 個月的術前（新輔助）化療，包括紫杉醇、5-氟尿嘧啶、環磷酰胺和多柔比星，然後手術切除了癌症。 對術前化療的反應被歸類為病理完全反應（pCR = 乳腺或淋巴結中無殘餘浸潤癌）或殘餘浸潤癌 (RD)，並用作預測終點 D。 終點 E 是通過免疫組織化學確定的臨床雌激素受體狀態。 使用 Affymetrix U133A 微陣列隨著時間的推移分多個批次進行 RNA 提取和基因表達譜分析。 先前報導了對這個連續累積的患者群體的一個子集的基因組分析。 對於每個端點，前 130 個案例用作訓練集，接下來的 100 個案例用作獨立驗證集。
MAQC-II項目
人類乳腺癌研究
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實例探究數據表JMP 基因組學
