具有基因表達數據的 D70 乳腺癌乳腺癌研究背景信息
人類乳腺癌 (BR) 數據集（端點 D 和 E）由德克薩斯大學 MD 安德森癌症中心（MDACC，休斯頓，德克薩斯州，美國）提供。 來自 230 例 I-III 期乳腺癌的基因表達數據是在任何治療之前從新診斷的乳腺癌的細針抽吸標本中產生的。 在 2000 年至 2008 年的前瞻性藥物基因組標記物發現研究中，依次收集活檢標本。 這些標本代表 70-90% 的純腫瘤細胞，基質污染最小。 患者接受了 6 個月的術前（新輔助）化療，包括紫杉醇、5-氟尿嘧啶、環磷酰胺和多柔比星，然後手術切除癌症。 對術前化療的反應分為病理完全反應（pCR = 乳房或淋巴結中無殘留浸潤性癌）或殘留浸潤性癌（RD），並用作預測的終點 D。 終點 E 是通過免疫組織化學確定的臨床雌激素受體狀態。 使用 Affymetrix U133A 微陣列隨時間分多批進行 RNA 提取和基因表達譜分析。 先前報導了對該順序累積的患者群體的一個子集的基因組分析。 對於每個端點，前 130 個案例用作訓練集，接下來的 100 個案例用作獨立驗證集。
MAQC-II項目
人類乳腺癌研究
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實例探究數據表
