JMP > Análisis factorial > Problema de estructura de entradaHola comunidad JMP,
Tengo un conjunto de datos grande (354 casos [filas] x 4800 variables [columnas]) derivado de un análisis metabolómico. Al revisar los datos mediante PCA, noté una clara separación de los datos en dos poblaciones (ver a continuación). Ahora, necesito evaluar la posible contribución de las propiedades de los casos (por ejemplo, género, edad, tratamiento) a esta separación.
Supuse que Factor Analysis sería la plataforma adecuada para utilizar, pero no comprendí cómo formatear correctamente la entrada para este análisis.
No puedo compartir los datos reales debido a su naturaleza confidencial. Por lo tanto, avíseme si sería útil que creara y compartiera una tabla simulada.
Mejor,
TS
Modelado estadístico avanzadoVentanasRe: JMP > Análisis factorial > Problema de estructura de entradaNingún problema @Thierry_S ,
No tengo experiencia con tantos factores.
Tal vez sea una buena idea tener una tabla de ejemplo para obtener más ideas de la comunidad.
Como ya identificó los grupos (es decir, la "y"), ¿qué pasa con la selección de respuestas para identificar (y filtrar) factores importantes? Creo que tienes que probar diferentes formas y comparar.
Re: JMP > Análisis factorial > Problema de estructura de entradaHola @georg ,
Gracias por recordarme los ejemplos y la guía de secuencias de comandos. Estudié estos ejemplos, pero todavía me cuesta aplicar este método a mi gran conjunto de datos. ¿Tiene sentido mirar 4800 variables en el análisis factorial? Estoy empezando a creer que mi pregunta original estaba equivocada.
Mejor,
TS
Re: JMP > Análisis factorial > Problema de estructura de entradaHola @Thierry_S , ¿revisó los dos ejemplos en el índice de secuencias de comandos?
Tal vez eso pueda guiarte. Buena suerte.
Names Default To Here( 1 );
dt = Open( "$SAMPLE_DATA/Cities.jmp" );
obj = dt << Principal Components(
Y( :OZONE, :CO, :SO2, :NO, :PM10 ),
"on Correlations"
);
obj << Factor Analysis( "ML", "SMC", 2, "Varimax" );
