JMP > Analyse factorielle > Problème de structure d'entréeSalut la communauté JMP,
J'ai un grand ensemble de données (354 cas [lignes] x 4800 variables [colonnes]) dérivé d'une analyse métabolomique. Lors de l'examen des données par PCA, j'ai remarqué une nette séparation des données en deux populations (voir ci-dessous). Maintenant, je dois évaluer la contribution possible des propriétés des cas (par exemple, le sexe, l'âge, le traitement) à cette séparation.

J'ai supposé que l'analyse factorielle serait la bonne plate-forme à utiliser, mais je n'ai pas compris comment formater correctement l'entrée pour cette analyse.
Je ne peux pas partager les données réelles en raison de leur nature confidentielle. Par conséquent, faites-moi savoir si cela aiderait si je créais et partageais une table fictive.
Meilleur,
TS
AnalytiqueTableau de donnéesles fenêtresRe : JMP > Analyse factorielle > Problème de structure d'entréeSalut @Thierry_S , avez-vous vérifié les deux exemples dans l'index de script ?
Cela peut peut-être vous guider. Bonne chance.
Names Default To Here( 1 );
dt = Open( "$SAMPLE_DATA/Cities.jmp" );
obj = dt << Principal Components(
Y( :OZONE, :CO, :SO2, :NO, :PM10 ),
"on Correlations"
);
obj << Factor Analysis( "ML", "SMC", 2, "Varimax" );

Re : JMP > Analyse factorielle > Problème de structure d'entréeSalut @Georg ,
Merci de me rappeler les exemples et le guide de script. J'ai étudié ces exemples, mais j'ai encore du mal à appliquer cette méthode à mon grand ensemble de données. Est-il même judicieux de regarder 4800 variables dans l'analyse factorielle ? Je commence à croire que ma question initiale était malavisée.
Meilleur,
TS