欠測値gwas分析こんにちは皆さん、
GWAS分析を実行しようとしています。 7番染色体で結果を取得すると、いくつかの欠落した値が表示されます。 なぜこのように見えるのかわかりません。 誰かが私を助けることができますか?

分析ウィンドウズRe:欠測値gwas分析やあ@SuperEla 、
JMPGenomicsまたはJMPProを使用していますか? どのバージョンですか?また、GWAS分析をどのように実行していますか?
ありがとう、
Re:欠測値gwas分析数秒前に私が考えたもう1つの考えは、各サンプルについて、その時点以降のSNPのデータが欠落している可能性があることでした。 遺伝子型は数値的にエンコードされていますか、それとも他のエンコードですか?
Re:欠測値gwas分析こんにちは@Chris_Kirchberg 、
迅速な返信ありがとうございます。 JMPGenomics13.2を使用しています。 ワークフロー>高度>遺伝的QK分析ワークフローを通じて分析を実行しました。
その情報が役立つかどうか教えてください。
Re:欠測値gwas分析@Chris_Kirchberg
遺伝子型は数値です。私の注釈データセット(マップ)にはすべての染色体のすべての情報が含まれているため、値が欠落してはならないことを理解しています。
Re:欠測値gwas分析情報のおかげで。そのバージョン番号は、JMPGenomicsが使用しているJMPのバージョンを指します。 [ヘルプ]>[JMPについて]オプションから番号を取得しましたか?
そのワークフローがデータセットに欠落している値を提供している理由がわかりません。 それは、それらのSNPの十分な非欠損遺伝子型データ(注釈が存在する場合でも)、またはそれらのSNPのQまたはK情報の欠損値などの他の理由のようないくつかの可能性があります。 そのワークフローに使用した設定を共有することは可能ですか? スクリーンショットは各タブに適しています。
この場合、連絡するのが最善かもしれないと思いますsupport@jmp.comその特定のバージョンのJMPゲノミクスの問題の原因をトラブルシューティングするのに役立つかどうかを確認します。