479862_fr-FR

liliconcom

Analyse gwas des valeurs manquantes

Bonjour à tous,

 

J'essaie d'exécuter mon analyse GWAS. Lors de l'obtention des résultats sur le chromosome 7, certaines valeurs manquantes apparaissent. Je ne comprends pas pourquoi il apparaît de cette façon. Est-ce que quelqu'un peut m'aider?

 

 

Analytiqueles fenêtresRe : Analyse gwas des valeurs manquantes

Salut @SuperEla ,

 

Utilisez-vous JMP Genomics ou JMP Pro ? Quelle version ?De plus, comment exécutez-vous votre analyse GWAS ?

Merci,

Re : Analyse gwas des valeurs manquantes

Une autre pensée que j'ai eue il y a quelques secondes était le potentiel de données manquantes pour ces SNP à partir de ce moment-là pour chacun de vos échantillons. Les génotypes sont-ils codés numériquement ou par un autre codage ?

Re : Analyse gwas des valeurs manquantes

Bonjour @Chris_Kirchberg ,

 

Merci pour la réponse rapide. J'utilise JMP Genomics 13.2. J'ai exécuté l'analyse via des flux de travail> avancé> flux de travail d'analyse QK génétique.

 

Faites-moi savoir si cette information vous aide.

Re : Analyse gwas des valeurs manquantes

@Chris_Kirchberg

 

Les génotypes sont numériques.Je comprends qu'il ne devrait y avoir aucune valeur manquante puisque mon ensemble de données d'annotation (carte) contient toutes les informations pour chaque chromosome.