결측값 gwa 분석모두들 안녕,
GWAS 분석을 실행하려고 합니다. 7번 염색체에서 결과를 얻을 때 일부 결측값이 나타납니다. 왜 이런 식으로 나타나는지 이해가 되지 않습니다. 누군가 나를 도울 수 있습니까?
해석학창Re: 누락된 값 gwa 분석안녕 @SuperEla ,
JMP Genomics 또는 JMP Pro를 사용하고 있습니까? 어떤 버전?또한 GWAS 분석을 어떻게 실행하고 있습니까?
감사해요,
Re: 누락된 값 gwa 분석몇 초 전에 내가 가졌던 또 다른 생각은 각 샘플에 대해 그 시점부터 해당 SNP에 대한 데이터가 누락될 가능성이 있다는 것입니다. 유전자형이 숫자로 인코딩되어 있습니까 아니면 다른 인코딩으로 되어 있습니까?
Re: 누락된 값 gwa 분석여보세요 @Chris_Kirchberg ,
빠른 답변 감사합니다. JMP Genomics 13.2를 사용하고 있습니다. 저는 워크플로 > 고급 > 유전자 QK 분석 워크플로를 통해 분석을 실행했습니다.
해당 정보가 도움이 되는지 알려주세요.
Re: 누락된 값 gwa 분석@Chris_Kirchberg
유전자형은 숫자입니다.내 주석 데이터 세트(지도)에 모든 염색체에 대한 모든 정보가 있으므로 누락된 값이 없어야 한다는 것을 이해합니다.
Re: 누락된 값 gwa 분석정보 주셔서 감사합니다.해당 버전 번호는 JMP Genomics에서 사용 중인 JMP 버전을 나타냅니다. 도움말>JMP 정보 옵션에서 번호를 받으셨습니까?
해당 워크플로가 데이터 세트에 누락된 값을 제공하는 이유가 확실하지 않습니다. 해당 SNP에 대한 누락되지 않은 유전자형 데이터가 충분하지 않거나(주석이 존재하더라도) 해당 SNP에 대한 Q 또는 K 정보에 대한 누락 값과 같은 다른 이유가 있을 수 있습니다. 해당 워크플로에 사용한 설정을 공유할 수 있습니까? 스크린샷은 각 탭에 적합합니다.
이 경우 연락하는 것이 가장 좋을 것 같습니다. support@jmp.com 특정 버전의 JMP Genomics에 대한 문제의 원인을 해결하는 데 도움이 될 수 있는지 확인합니다.
