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Fehlende Werte gwas-Analyse

Hallo alle,

Ich versuche, meine GWAS-Analyse auszuführen. Beim Erhalten der Ergebnisse in Chromosom 7 erscheinen einige fehlende Werte. Ich verstehe nicht, warum es so erscheint. Kann mir jemand helfen?

Analytik

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Betreff: Fehlende Werte gwas Analyse

Hi @SuperEla ,

Verwenden Sie JMP Genomics oder JMP Pro? Welche Version?Und wie führen Sie Ihre GWAS-Analyse durch?

Vielen Dank,

Betreff: Fehlende Werte gwas Analyse

Ein weiterer Gedanke, den ich vor ein paar Sekunden hatte, war die Möglichkeit, dass ab diesem Zeitpunkt für jede Ihrer Proben Daten für diese SNPs fehlen. Werden die Genotypen numerisch oder anderweitig kodiert?

Betreff: Fehlende Werte gwas Analyse

Hallo @Chris_Kirchberg ,

Danke für die schnelle Antwort. Ich verwende JMP Genomics 13.2. Ich habe die Analyse über Workflows > Erweitert > Arbeitsablauf für genetische QK-Analyse durchgeführt.

Lassen Sie mich wissen, ob diese Informationen helfen.

Betreff: Fehlende Werte gwas Analyse

@Chris_Kirchberg

Die Genotypen sind numerisch.Ich verstehe, dass es keinen fehlenden Wert geben sollte, da mein Annotationsdatensatz (Karte) alle Informationen für jedes Chromosom enthält.

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