Je ne comprends pas mes donnéesJe dois calculer la prévalence d'un groupe d'ectoparasites chez les oiseaux et tester les hypothèses concernant les effets des paramètres du cycle biologique de l'hôte et du parasite sur la prévalence de ces ectoparasites. On m'a dit d'utiliser GLMM et j'ai commencé à l'utiliser sur jmp, mais je ne comprends pas la sortie du programme. Je crois que les données d'entrée sont erronées et je ne comprends pas pourquoi...
Ma variable de réponse est présence vs absence (0/1), mon effet aléatoire est le sous-ordre des ectoparasites (A/B), et mes effets fixes sont leur alimentation (sang/plume), écomorphe (A, B, C, D) et dispersion (0/1/2).
Pour les échantillons où le parasite est absent, les lignes des effets fixes et aléatoires ont un N/A.
J'aimerais comprendre si le modèle que j'essaie de construire est correct.
Merci!
AnalytiqueTableau de donnéesRe : Je ne comprends pas mes donnéesTout d'abord, cette communauté est destinée à JMP, pas à Microsoft, vous devez donc fournir votre exemple dans JMP, pas dans Excel.
Quelle distribution avez-vous utilisé avec le GLMM ? Quelle fonction de lien avez-vous utilisée ?
Je ne vois pas que le sous-ordre soit un effet aléatoire. Avez-vous un terme dans le modèle pour le sujet, l'échantillon ou le bloc ? c'est probablement l'effet aléatoire dans la réponse.
Pouvez-vous montrer les résultats sous forme d'image de la plate-forme JMP ?
Re : Je ne comprends pas mes donnéesDésolé, je suis nouveau sur la plateforme. Je m'excuse pour mon erreur.
Je pensais que les sous-ordres seraient l'effet aléatoire car l'effet fixe en dépend. Selon le sous-ordre, le régime alimentaire, la dispersion et l'écomorphe sont dictés.J'ai joint les captures d'écran de mon modèle et la sortie que j'ai obtenue du programme.
Sur le résumé des effets, les effets n'ont aucune valeur. Cela signifierait-il qu'ils n'ont aucun effet sur la prévalence?
Re : Je ne comprends pas mes donnéesVous dites, " les sous-ordres seraient l'effet aléatoire car l'effet fixe en dépend. " Parlez-vous de niveaux imbriqués. Par exemple, dans ce cas
Si les niveaux du facteur B sont tels que le niveau 1 de la première ligne est le premier et le niveau 1 de la troisième ligne est le premier, mais qu'ils ne sont pas du même niveau, alors le facteur B est imbriqué dans le facteur A. Pensez à un cas où deux parties sont testées aux deux niveaux du facteur A, mais ce ne sont pas les mêmes parties. Il y a alors en fait 4 pièces testées. D'autre part, si le Facteur B = 1 est le même pour le Facteur A = 1 ou 2, alors le Facteur A et le Facteur B sont croisés. En utilisant le même exemple, il n'y a que deux pièces qui sont chacune testées dans les deux conditions du facteur A.
J'ai besoin de savoir quel cas (croisé ou imbriqué) pour être sûr que vous avez correctement spécifié les effets fixes.
J'essaierais toujours d'inclure Sub-order comme l'un des effets fixes. Si cela fonctionne, vous n'avez pas besoin de GLMM. Vous pouvez utiliser la personnalité GLM à la place.
Re : Je ne comprends pas mes donnéesOui, ce sont des facteurs imbriqués ! Chaque sous-ordre se produit en combinaison avec différents niveaux de variables.
Plus précisément, le sous-ordre A ne se nourrira que de sang et le sous-ordre B ne se nourrira que de plumes. Alors le sous-ordre A ne peut pas se disperser ou a un écomorphe, tandis que le sous-ordre B peut se disperser ou non et avoir un ensemble de quatre écomorphes différents.
Re : Je ne comprends pas mes donnéesVous n'avez donc pas besoin d'effets aléatoires. Vous indiquez l'imbrication en ajoutant d'abord les facteurs supérieur et inférieur aux effets. Sélectionnez ensuite le facteur supérieur dans la liste des colonnes et le facteur inférieur (imbriqué) dans la liste des effets, puis cliquez sur Imbriquer.
Veuillez répondre avec votre résultat.
Re : Je ne comprends pas mes donnéesD'accord merci!
La dispersion et l'écomorphe n'étaient pas significatifs, et le régime alimentaire et le sous-ordre n'ont pas de valeur, cela signifie donc qu'aucun d'entre eux n'affecte la prévalence ?
