到现在为止，很多人都已经看到了最近的公告3 月 31 日之后，我们当前的 JMP Genomics 产品将不再向新客户销售英石。这一决定在内部引发了一些问题，当客户听到这个消息时，我们预计他们也会有类似的问题。 以下是其中一些问题以及开发和产品管理的答案。
问：我们是否会放弃 JMP Genomics 客户？“-omic”数据分析方法和工具仍然是我们产品愿景和路线图的重要组成部分吗？
答案：不，我们不会放弃我们的客户，是的，我们完全打算比以往更好地支持我们的 Genomics 和相关生命科学客户 - 但现在使用 JMP Pro，而不是专门用于基因组学的单独产品。 基因组学领域的用途和重要性正在不断增长，而不仅仅是学术或基础研究，我们预计我们当前和未来的客户将希望使用我们的产品来解决该领域的重要问题。
问：为什么我们现在要采取这一行动，而且速度如此之快？
答案：JMP Pro 17 计划的改进将提供先进水平的功能和性能，使其能够独立运行，而不需要 SAS 提供额外的分析功能。此外，我们现在必须开辟自己的道路，今年之后我们将不再提供 SAS 产品作为我们任何 JMP 产品的一部分。与此同时，我们已经制定了实施过渡的计划，使我们的生命科学产品仅使用 JMP。考虑到所有这些因素，现在是做出这个决定的最佳时机。
问题：这种转变会带来哪些好处？
回答：之前的 JMP Genomics 产品有一个 JMP 前端并使用 SAS 作为后端，因此有一些缺点：
- 安装起来很困难，因为它需要一个很大的安装包（12 GB），主要是因为 SAS 组件。 现在，借助 JMP Pro 中的 Genomics，可以轻松下载（小于 1 GB）且安装快速。
- Genomics 用户必须订购特殊版本的 JMP。 现在，他们将在 JMP Pro 中拥有所需的功能 - 无需获取不同的产品或附加组件。
- 以前的版本需要 SAS，因为 JMP 不具备处理基因组数据所需的所有功能，包括导入和一些统计方法。 现在 JMP 几乎可以完成所有这些事情，而无需 SAS。
- 在磁盘上使用 SAS 数据集会遇到磁盘访问速度慢、未压缩文件较大以及 SAS 和 JMP 文件之间不匹配的问题。 在 JMP Pro 下，文件将以压缩形式变得更小，所有平台都可以直接访问，并且所有分析都将在内存中进行，速度要快得多。
- 以前，文件通常必须堆叠成“高”的形式，列数很少，行数却很大。 高形式是浪费的，主题数据在该主题的所有元素中重复。 “宽”形式要好得多；它不仅更加紧凑，而且利用 JMP Pro 中的许多新功能，使处理广泛的数据变得快速、轻松。
- 我们消除了 JMP Pro 17 中的瓶颈，这些瓶颈之前导致处理数十万列速度变慢。 常用的例程现在是多线程的，并针对广泛的问题进行了优化，有时比以前快数百倍。
问题：JMP Pro 17 中有哪些功能和特性可以满足当前 Genomics 用户的需求并吸引基因组数据科学家？
答案：JMP Pro 17 将是唯一的高级分析软件包之一，它提供了交互式和引人入胜的用户体验的组合，允许快速点击式探索基因组数据、先进的多变量和预测建模工具以及灵活且自适应平台（通过 JMP 脚本并与其他数据科学工具集成）。 JMP Pro 针对此类工作的新功能包括：
- 多个平台的性能和输出增强（包括反应筛选,主要成分,适合模型,适合混合,分层的聚类, K 均值聚类) 更好地处理又大又宽的桌子
- 具有两个新平台的新遗传学子菜单：标记统计和标记模拟
- 新的多变量降维和汇总方法，包括 t-SNE 和 UMAP多元嵌入平台
- 简化 Illumina IDAT 文件的导入
- 新的详细培训材料提供了大量技巧、策略和常见的基因组学分析工作流程
用于分析基因组数据的传统工具往往是基于编程的，需要较长的学习曲线来学习编程语言。 JMP Pro 的一切都是交互式的、点击式的、易于安装和使用的。 所有图表都是完全交互式的，分析成为一次发现之旅，跟随线索并从图表中寻求见解。 将此与基于脚本的提前计划、学习负担重的工作流程进行对比，后者在开源工具的流程中占主导地位。 借助 JMP，研究人员可以专注于主题，而不是花费所有时间与分析工具作斗争。对于已经具备这些编程和基于脚本的技能和工具的高级用户来说，JMP Pro 也将使他们受益，使他们能够进行快速交互式分析，以便他们能够快速了解自己的数据，并使他们能够更好地分享自己的见解和其他人。
问题：JMP Pro 17 基因组数据分析是否具有相同的用户体验，还是会有所不同？
回答：面向 Genomics 用户的 JMP Pro 17 的操作方式将与 JMP Genomics 产品不同：用户将能够直接访问简单的数据，而不是重塑和表征数据以使其适合预先确定的分析工作流程。使用 JMP Pro 中的工具并制定自己的自定义工作流程。
还有其他问题吗？
如果您有任何其他问题，请随时在下面发表评论或发送给 Sam Gardner ( @萨姆加德纳）在 JMP 产品管理中。
@wendytseng我不确定针对许多列优化的确切项目。 或许@萨姆加德纳从发展中就能发现。
关于以下好处……只有Pro版才有吗？例如，在其他条件相同的情况下，JMP 与 JMP Pro 中的响应筛选性能是否会有所不同？
“我们已经消除了 JMP Pro 17 中的瓶颈，这些瓶颈之前导致数十万列的处理速度变慢。常用的例程现在是多线程的，并针对广泛的问题进行了优化，有时比前。”
@wendytseng ，据我所知，没有一个列表。 最好指出我们可以做什么，如果用户想要的东西不存在，但他们在 JMP Genomics 中做过，那么将其放入愿望清单中。 JMP/JMP Pro 中没有但 JMP Genomics 中有很多功能。 JMP Genomics 处理数据的方式可以在 JMP/JMP Pro 中完成，但需要采取多个步骤并结合一些不同的功能。
JMP Genomics 的哪些功能不是在 JMP Pro 中？（请告诉我此信息是否存在于其他地方。）
我们不会为 JMP Pro 提供单独的 Genomics 菜单或 Genomics Starter。有两个新平台：“标记统计”和“标记模拟”，它们位于“分析”菜单下的单独子菜单中。
新 JMP Pro 上是否有 Genomics 菜单，而不是当前 JMP Genomics 的 Genomics Starter？
@唐麦考马克JMP Pro 将配备所有这些平台和功能。
新的 JMPG 平台是否可供所有 JMP Pro 用户使用？
