지금까지 많은 분들이 보셨겠지만 최근 발표 현재 JMP Genomics 제품은 3월 31일 이후에는 더 이상 신규 고객에게 판매되지 않습니다. 성 .이번 결정으로 인해 내부적으로 여러 가지 질문이 제기됐고, 고객들도 이 소식을 들으면 비슷한 질문을 하게 될 것으로 예상됩니다. 다음은 이러한 질문 중 일부와 개발 및 제품 관리의 답변입니다.
질문: JMP Genomics 고객을 떠나는 건가요?"-omic" 데이터 분석 방법과 도구가 여전히 제품 비전과 로드맵에서 중요한 부분입니까?
답변: 아니요, 우리는 고객을 버리는 것이 아닙니다. 그렇습니다. 우리는 유전체학 및 관련 생명과학 고객을 그 어느 때보다 더 잘 지원할 계획입니다. 하지만 이제 유전체학 전용 제품이 아닌 JMP Pro를 사용하게 되었습니다. 유전체학 분야는 학문적 또는 기초 연구를 넘어 그 활용도와 중요성이 커지고 있으며, 현재와 미래의 고객이 우리 제품을 사용하여 이 분야의 중요한 문제를 해결하기를 원할 것으로 기대합니다.
질문: 우리는 왜 지금 이 순간 그렇게 빠르게 움직이고 있습니까?
답변: JMP Pro 17에 계획된 개선 사항은 SAS가 추가 분석 기능을 제공할 필요 없이 자체적으로 작동할 수 있는 고급 수준의 기능과 성능을 제공할 것입니다.또한, 우리는 이제 우리만의 길을 개척해야 하며 올해 이후에는 더 이상 JMP 제품의 일부로 SAS 제품을 제공하지 않을 것입니다.동시에 생명과학 제품에 JMP만 사용하도록 전환하려는 계획도 이미 마련되어 있었습니다.이러한 모든 고려 사항을 고려할 때 지금이 결정을 내리기에 가장 좋은 시기입니다.
질문: 이번 전환을 통해 어떤 이점이 있습니까?
답변: 이전 JMP Genomics 제품에는 JMP 프런트엔드가 있고 SAS를 백엔드로 사용했기 때문에 다음과 같은 몇 가지 단점이 있었습니다.
- 주로 SAS 구성 요소로 인해 대용량 설치 패키지(12GB)가 필요했기 때문에 설치가 어려웠습니다. 이제 JMP Pro에 Genomics가 포함되어 있어 다운로드가 쉽고(1GB 미만) 설치도 빠릅니다.
- Genomics 사용자는 JMP의 특별 버전을 주문해야 했습니다. 이제 JMP Pro에 필요한 기능이 포함되어 있으므로 다른 제품이나 추가 기능을 구입할 필요가 없습니다.
- 이전 버전에서는 JMP에 가져오기 및 일부 통계 방법을 포함하여 Genomics 데이터를 처리하는 데 필요한 모든 기능이 없었기 때문에 SAS가 필요했습니다. 이제 JMP는 SAS 없이도 이러한 거의 모든 작업을 수행할 수 있습니다.
- 디스크에서 SAS 데이터 세트를 사용하면 느린 디스크 액세스, 압축되지 않은 대용량 파일, SAS와 JMP 파일 간의 불일치 등의 문제가 발생했습니다. JMP Pro를 사용하면 파일 크기가 훨씬 작아지고 압축된 형태로 모든 플랫폼에서 직접 액세스할 수 있으며 모든 분석이 메모리 내에서 훨씬 더 빨라집니다.
- 이전에는 파일이 열은 적고 행은 엄청나게 많은 "긴" 형식으로 쌓아야 하는 경우가 많았습니다. 키가 큰 형식은 해당 주제의 모든 요소에 걸쳐 주제 데이터가 반복되므로 낭비였습니다. "넓은" 형식이 훨씬 더 좋습니다. 훨씬 더 작을 뿐만 아니라 JMP Pro의 많은 새로운 기능을 활용하여 광범위한 데이터를 빠르고 쉽게 처리할 수 있습니다.
- 이전에 수십만 개의 열을 처리하는 속도를 느리게 만들었던 병목 현상을 JMP Pro 17에서 제거했습니다. 일반적으로 사용되는 루틴은 이제 다중 스레드로 구성되어 광범위한 문제에 최적화되었으며 때로는 이전보다 수백 배 더 빠릅니다.
질문: JMP Pro 17에는 현재 Genomics 사용자의 요구 사항을 충족하고 게놈 데이터 과학자의 관심을 끌 만한 기능과 특징이 있습니까?
답변: JMP Pro 17은 게놈 데이터의 신속한 포인트 앤 클릭 탐색, 고급 다변량 및 예측 모델링 도구, 유연하고 적응형 플랫폼(JMP 스크립팅 및 기타 데이터 과학 도구와의 통합을 통해) 이러한 유형의 작업을 위한 JMP Pro의 새로운 기능은 다음과 같습니다.
- 여러 플랫폼에 대한 성능 및 출력 향상(포함) 반응 선별 , 주요 구성 요소 , 모델 맞춤 , 핏 혼합 , 계층적 클러스터링 , K-평균 클러스터링 ) 크고 넓은 테이블을 더 잘 처리하기 위해
- 두 가지 새로운 플랫폼이 포함된 새로운 유전학 하위 메뉴: 마커 통계 그리고 마커 시뮬레이션
- t-SNE 및 UMAP를 포함한 다변량 차원 축소 및 요약 방법을 새로운 방식으로 다변량 임베딩 플랫폼
- Illumina IDAT 파일 가져오기 간소화
- 다양한 팁, 전략 및 일반적인 유전체학 분석 워크플로우를 제공하는 새로운 세부 교육 자료
유전체학 데이터를 분석하기 위한 기존 도구는 프로그래밍 기반인 경향이 있어 프로그래밍 언어를 배우려면 오랜 학습 곡선이 필요했습니다. JMP Pro를 사용하면 모든 것이 대화형, 포인트 앤 클릭 방식으로 쉽게 작동하고 사용할 수 있습니다. 모든 그래프는 완전히 대화형이며, 분석은 그래프에서 단서를 찾고 통찰력을 추구하는 발견의 항해가 됩니다. 이는 오픈 소스 도구를 사용하여 프로세스를 지배하는 사전 학습 부담이 큰 스크립트 기반 작업 프로세스와 대조됩니다. JMP를 사용하면 연구자들은 분석 도구와 씨름하는 데 시간을 낭비하지 않고 주제에 집중할 수 있습니다.프로그래밍과 스크립트 기반 기술 및 도구를 이미 갖춘 고급 사용자에게도 JMP Pro는 신속한 대화형 분석 기능을 제공하여 데이터를 빠르게 이해하고 통찰력을 더 잘 공유할 수 있도록 하여 도움이 될 것입니다. 다른 사람들과.
질문: JMP Pro 17의 유전체학 데이터 분석은 사용자 경험이 동일합니까, 아니면 다를까요?
답변: Genomics 사용자를 위한 JMP Pro 17의 작업 스타일은 JMP Genomics 제품과 다릅니다. 미리 결정된 분석 작업 흐름에 맞도록 데이터를 재구성하고 특성화하는 대신 사용자는 쉬운 작업에 직접 액세스할 수 있습니다. JMP Pro의 도구를 사용하고 자신만의 맞춤형 작업 흐름을 만들 수 있습니다.
추가 질문이 있으신가요?
다른 질문이 있으시면 아래에 댓글을 달거나 Sam Gardner(Sam Gardner)에게 보내주세요. @샘가드너 ) JMP 제품 관리에서.
@wendytseng 많은 열에 최적화된 정확한 항목이 확실하지 않습니다. 아마도 @샘가드너 개발을 통해 알 수 있을 것이다.
다음 혜택에 관해서는...Pro에만 해당되나요?예를 들어, JMP와 JMP Pro의 응답 선별에서 다른 성능이 동일하다고 기대할 수 있습니까?
"JMP Pro 17에서는 이전에 수십만 개의 열을 처리하는 속도를 느리게 만들었던 병목 현상을 제거했습니다.일반적으로 사용되는 루틴은 이제 다중 스레드로 구성되어 광범위한 문제에 최적화되었습니다. , 때로는 수백 배 빠른 경우도 있습니다. 전에."
@wendytseng , 제가 아는 목록이 없습니다. 우리가 무엇을 할 수 있는지, 그리고 사용자가 원하는 것이 거기에 없지만 JMP Genomics에서 했던 일이라면 이를 위시 리스트에 추가하는 것이 좋습니다. JMP/JMP Pro에는 없지만 JMP Genomics에는 있었던 기능이 많이 있습니다. JMP Genomics가 데이터에 접근하는 방식은 JMP/JMP Pro에서 수행할 수 있지만 몇 가지 다른 기능을 결합하여 여러 단계를 거쳐야 합니다.
JMP Genomics의 어떤 기능이 아니다 JMP Pro에서?(이 정보가 다른 곳에 있으면 알려주세요.)
JMP Pro에는 별도의 Genomics 메뉴나 Genomics Starter가 제공되지 않습니다.Analyze.menu 아래 별도의 하위 메뉴 메뉴에 Marker Statistics와 Marker Simulation이라는 두 가지 새로운 플랫폼이 있습니다.
기존 JMP Genomics의 Genomics Starter 대신 새로운 JMP Pro에 Genomics 메뉴가 있습니까?
@돈맥코맥 JMP Pro에는 이러한 모든 플랫폼과 기능이 함께 제공됩니다.
모든 JMP Pro 사용자가 새로운 JMPG 플랫폼을 사용할 수 있나요?
