到现在，很多人都看过最近的公告我们目前的 JMP Genomics 产品将在 3 月 31 日之后不再出售给新客户英石.这一决定在内部引发了几个问题，当客户听到这个消息时，我们预计他们也会有类似的问题。 以下是其中一些问题以及来自开发和产品管理的答案。
问题：我们是否要放弃我们的 JMP Genomics 客户？“-omic”数据分析方法和工具是否仍然是我们产品愿景和路线图的重要组成部分？
答：不，我们不会放弃我们的客户，是的，我们完全打算比以往更好地支持我们的基因组学和相关生命科学客户 - 但现在使用 JMP Pro，而不是专门用于基因组学的单独产品。 基因组学领域的使用和重要性正在增长，不仅仅是学术或基础研究，我们预计我们当前和未来的客户将希望使用我们的产品来解决该领域的重要问题。
问题：为什么我们现在就采取行动，而且如此之快？
答：为 JMP Pro 17 计划的改进将提供高级别的功能和性能，使其能够独立运行，而无需 SAS 提供额外的分析功能。此外，我们现在必须开辟自己的道路，今年之后我们将不再提供 SAS 产品作为我们任何 JMP 产品的一部分。与此同时，我们已经制定了实施过渡的计划，以使我们的生命科学产品仅使用 JMP。考虑到所有这些因素，现在是做出此决定的最佳时机。
问题：这种转变会带来哪些好处？
答：之前的 JMP Genomics 产品有一个 JMP 前端并使用 SAS 作为后端，因此存在一些缺点：
- 它很难安装，因为它需要一个大的安装包（12 GB），主要是因为 SAS 组件。 现在，借助 JMP Pro 中的 Genomics，它易于下载（小于 1 GB）并且安装速度很快。
- 基因组学用户必须订购特殊版本的 JMP。 现在，他们将在 JMP Pro 中拥有所需的功能 - 无需获取不同的产品或附加组件。
- 以前的版本需要 SAS，因为 JMP 不具备处理基因组数据所需的所有功能，包括导入和一些统计方法。 现在 JMP 几乎可以在不需要 SAS 的情况下完成所有这些事情。
- 在磁盘上使用 SAS 数据集会遇到磁盘访问速度慢、未压缩文件大以及 SAS 和 JMP 文件不匹配的问题。 在 JMP Pro 下，文件会更小，压缩形式，所有平台都可以直接访问，所有分析都将在内存中进行，而且速度要快得多。
- 以前，文件通常必须堆叠成“高”的形式，列数很少，行数很大。 高大的表格很浪费，主题数据在该主题的所有元素中重复。 “宽”形式要好得多；它不仅更紧凑，而且利用 JMP Pro 中的许多新功能来快速轻松地处理大量数据。
- 我们已经消除了 JMP Pro 17 中之前处理数十万列速度缓慢的瓶颈。 常用的例程现在是多线程的，并针对广泛的问题进行了优化，有时比以前快数百倍。
问题：JMP Pro 17 中将有哪些功能和特性可以满足当前 Genomics 用户的需求并吸引基因组数据科学家？
回答：JMP Pro 17 将是唯一的高级分析软件包之一，它结合了交互式和引人入胜的用户体验，允许对基因组数据进行快速的点击式探索，先进的多变量和预测建模工具，以及灵活的自适应平台（通过 JMP 脚本和与其他数据科学工具的集成）。 JMP Pro 针对此类工作的新功能包括：
- 对多个平台的性能和输出增强（包括反应筛选,主成分,拟合模型,适合混合,分层的聚类, K-Means 聚类) 以更好地处理大而宽的桌子
- 带有两个新平台的新遗传学子菜单：标记统计和标记模拟
- 一种新的多变量降维和汇总方法，包括 t-SNE 和 UMAP多元嵌入平台
- 简化 Illumina IDAT 文件的导入
- 新的详细培训材料，提供大量提示、策略和常见的基因组学分析工作流程
用于分析基因组数据的传统工具往往是基于编程的，需要很长的学习曲线来学习编程语言。 使用 JMP Pro，一切都是交互式的、点击式的、简单易用的。 所有的图表都是完全交互的，分析变成了一次发现之旅，跟随线索，从图表中寻求洞察力。 将此与预先计划学习负担重的基于脚本的工作流程进行对比，后者使用开源工具主导该流程。 使用 JMP，研究人员可以专注于主题，而不是花费所有时间与分析工具作斗争。对于已经具备这些编程和基于脚本的技能和工具的高级用户，JMP Pro 也将对他们有益，使他们能够进行快速的交互式分析，以便他们能够快速了解他们的数据并更好地分享他们的见解和其他人。
问题：JMP Pro 17 对基因组数据的分析会有相同的用户体验，还是会有所不同？
答：JMP Pro 17 for Genomics 用户的操作方式将与 JMP Genomics 产品不同：用户无需重新塑造和表征您的数据以使其适合预先确定的分析工作流程，而是能够直接访问简单的使用 JMP Pro 中的工具并制作自己的自定义工作流程。
还有其他问题吗？
如果您有任何其他问题，请随时在下面发表评论或将其发送给 Sam Gardner ( @SamGardner ) 在 JMP 产品管理中。
所有 JMP Pro 用户都可以使用新的 JMPG 平台吗？
@DonMcCormack JMP Pro 将配备所有这些平台和功能。
新 JMP Pro 上是否有 Genomics 菜单，而不是当前 JMP Genomics 的 Genomics Starter？
我们不会为 JMP Pro 提供单独的 Genomics 菜单或 Genomics Starter。有两个新平台，Marker Statistics 和 Marker Simulation，它们位于 Analyze.menu 下的单独子菜单菜单中。
