지금까지 많은 분들이 보셨겠지만 최근 발표 현재 JMP Genomics 제품은 3월 31일 이후에 신규 고객에게 더 이상 판매되지 않습니다. 성 .이 결정으로 인해 내부적으로 몇 가지 질문이 제기되었으며 고객이 이 소식을 듣게 되면 비슷한 질문을 하게 될 것으로 예상됩니다. 다음은 개발 및 제품 관리의 답변과 함께 이러한 질문 중 일부입니다.
질문: JMP Genomics 고객을 포기합니까?"-omic" 데이터 분석 방법과 도구가 여전히 우리 제품 비전과 로드맵의 중요한 부분입니까?
답변: 아니요, 우리는 고객을 버리지 않고 있습니다. 예, 우리는 유전체학 및 관련 생명과학 고객을 그 어느 때보다 더 잘 지원할 계획입니다. 그러나 이제 유전체학 전용 제품이 아닌 JMP Pro를 통해 지원합니다. 유전체학 분야는 학문적이거나 기초적인 연구를 넘어 사용과 중요성이 커지고 있으며 현재 및 미래의 고객이 이 분야의 중요한 문제를 해결하기 위해 당사 제품을 사용하기를 원할 것으로 기대합니다.
질문: 왜 우리는 지금 이 움직임을 그렇게 빨리 하고 있습니까?
답변: JMP Pro 17에 대해 계획된 개선 사항은 SAS가 추가 분석 기능을 제공할 필요 없이 자체적으로 설 수 있도록 하는 고급 수준의 기능 및 성능을 제공할 것입니다.또한 이제 우리는 우리만의 길을 개척해야 하며 올해 이후에는 더 이상 JMP 제품의 일부로 SAS 제품을 제공하지 않을 것입니다.동시에 우리의 생명 과학 제품이 JMP만을 사용하도록 전환하는 계획이 이미 마련되어 있었습니다.이러한 모든 고려 사항을 고려할 때 지금이 결정을 내리기에 가장 좋은 시기입니다.
질문: 이 전환의 이점은 무엇입니까?
답변: 이전 JMP Genomics 제품에는 JMP 프런트 엔드가 있었고 SAS를 백엔드로 사용했기 때문에 몇 가지 단점이 있었습니다.
- 주로 SAS 구성 요소 때문에 큰 설치 패키지(12GB)가 필요하여 설치하기 어려웠습니다. 이제 JMP Pro의 Genomics를 사용하여 다운로드하기 쉽고(1GB 미만) 빠르게 설치할 수 있습니다.
- Genomics 사용자는 JMP의 특별 버전을 주문해야 했습니다. 이제 JMP Pro 내부에 필요한 기능을 갖게 되며 다른 제품이나 추가 기능을 얻을 필요가 없습니다.
- JMP에는 가져오기 및 일부 통계 방법을 포함하여 Genomics 데이터를 처리하는 데 필요한 모든 기능이 없었기 때문에 이전 버전에서는 SAS가 필요했습니다. 이제 JMP는 SAS 없이도 이러한 거의 모든 작업을 수행할 수 있습니다.
- 디스크에서 SAS 데이터 세트를 사용하면 느린 디스크 액세스, 압축되지 않은 대용량 파일, SAS와 JMP 파일 간의 불일치 문제가 발생했습니다. JMP Pro에서 파일은 압축된 형식으로 훨씬 작아지고 모든 플랫폼에서 직접 액세스할 수 있으며 모든 분석은 메모리 내에서 훨씬 더 빨라집니다.
- 이전에는 파일이 열이 거의 없고 행이 많은 "높은" 형식으로 쌓이는 경우가 많았습니다. 키가 큰 형식은 낭비였으며 해당 주제의 모든 요소에 걸쳐 주제 데이터가 반복되었습니다. "넓은" 형태가 훨씬 좋습니다. 훨씬 더 컴팩트할 뿐만 아니라 JMP Pro의 많은 새로운 기능을 활용하여 광범위한 데이터를 빠르고 쉽게 처리할 수 있습니다.
- 이전에 수십만 개의 열을 느리게 처리하던 JMP Pro 17의 병목 현상을 제거했습니다. 일반적으로 사용되는 루틴은 이제 다중 스레드되고 광범위한 문제에 최적화되어 있으며 때로는 이전보다 수백 배 더 빠릅니다.
질문: JMP Pro 17에는 현재 Genomics 사용자의 요구를 충족하고 게놈 데이터 과학자를 끌어들일 수 있는 어떤 기능과 기능이 있습니까?
답변: JMP Pro 17은 게놈 데이터의 신속한 포인트 앤 클릭 탐색, 고급 다변량 및 예측 모델링 도구, 유연하고 매력적인 사용자 경험의 조합을 제공하는 유일한 고급 분석 소프트웨어 패키지 중 하나가 될 것입니다. 적응형 플랫폼(JMP 스크립팅 및 다른 데이터 과학 도구와의 통합을 통해). 이러한 유형의 작업을 위한 JMP Pro의 새로운 기능은 다음과 같습니다.
- 여러 플랫폼에 대한 성능 및 출력 향상( 응답 심사 , 주성분 , 적합 모델 , 믹스 핏 , 계층적 클러스터링 , K-평균 클러스터링 ) 크고 넓은 테이블을 더 잘 처리하기 위해
- 두 가지 새로운 플랫폼이 있는 새로운 유전학 하위 메뉴: 마커 통계 그리고 마커 시뮬레이션
- t-SNE 및 UMAP를 포함한 다변수 차원 축소 및 요약 방법은 새로운 다변수 임베딩 플랫폼
- Illumina IDAT 파일 가져오기 간소화
- 다양한 팁, 전략 및 일반적인 게놈 분석 워크플로를 제공하는 새로운 상세 교육 자료
유전체학 데이터를 분석하기 위한 기존 도구는 프로그래밍 기반 경향이 있어 프로그래밍 언어를 배우기 위해 긴 학습 곡선이 필요했습니다. JMP Pro를 사용하면 모든 것이 인터랙티브하고 포인트 앤 클릭 방식으로 작동하며 사용이 간편합니다. 모든 그래프는 완전히 상호 작용하며 분석은 단서를 따르고 그래프에서 통찰력을 추구하는 발견의 항해가 됩니다. 이를 오픈 소스 도구로 프로세스를 지배하는 사전 계획 학습 부담이 있는 스크립트 기반 작업 프로세스와 대조하십시오. JMP를 사용하면 연구원은 분석 도구와 씨름하는 데 모든 시간을 할애하지 않고 주제에 집중할 수 있습니다.이러한 프로그래밍 및 스크립트 기반 기술과 도구를 이미 보유한 고급 사용자의 경우 JMP Pro도 도움이 될 것입니다. 즉, 빠른 대화형 분석을 수행하여 데이터를 빠르게 이해하고 통찰력을 더 잘 공유할 수 있습니다. 다른 사람들과.
질문: JMP Pro 17의 유전체학 데이터 분석은 동일한 사용자 경험을 제공합니까, 아니면 다를까요?
답변: Genomics 사용자를 위한 JMP Pro 17의 작동 스타일은 JMP Genomics 제품과 다릅니다. 미리 결정된 분석 워크플로에 맞게 데이터를 재구성하고 특성화하는 대신 사용자가 직접 쉽게 액세스할 수 있습니다. JMP Pro에서 도구를 사용하고 고유한 사용자 정의 워크플로를 만들 수 있습니다.
추가 질문이 있으신가요?
다른 질문이 있는 경우 아래에 댓글을 달거나 Sam Gardner( @SamGardner ) JMP 제품 관리에서.
모든 JMP Pro 사용자가 새로운 JMPG 플랫폼을 사용할 수 있습니까?
@DonMcCormack JMP Pro는 이러한 모든 플랫폼과 기능과 함께 제공됩니다.
현재 JMP Genomics의 Genomics Starter 대신 새로운 JMP Pro에 Genomics 메뉴가 있습니까?
JMP Pro를 위한 별도의 Genomics 메뉴나 Genomics Starter는 제공하지 않습니다.Analyze.menu 아래 별도의 하위 메뉴에 있는 두 개의 새로운 플랫폼인 Marker Statistics 및 Marker Simulation이 있습니다.
