今までに、あなたの多くは見た最近の発表現在のJMPGenomics製品は、3月31日以降は新規顧客に販売されなくなります。 st 。この決定により、社内でいくつかの質問が発生しました。お客様がこのニュースを聞くと、同様の質問が発生することが予想されます。 これらの質問のいくつかと、開発および製品管理からの回答を以下に示します。
質問:JMP Genomicsの顧客を放棄していますか?「-omic」データ分析の方法とツールは、依然として当社の製品ビジョンとロードマップの重要な部分ですか?
回答:いいえ、お客様を放棄するわけではありません。はい、ゲノミクスおよび関連するライフサイエンスのお客様をこれまで以上にサポートするつもりですが、現在はJMP Proを使用しており、ゲノミクス専用の個別の製品ではありません。 ゲノミクスの分野は、学術研究や基礎研究だけでなく、その使用と重要性が増しており、現在および将来のお客様は、この分野の重要な問題を解決するために当社の製品を使用したいと考えています。
質問:なぜ私たちは今、そしてとても速くこの動きをしているのですか?
回答:JMP Pro 17で計画されている改善により、SASが追加の分析機能を提供しなくても、JMPPro17を独立させることができる高度なレベルの機能とパフォーマンスが提供されます。さらに、私たちは今、独自の道を築く必要があり、今年以降、JMP製品の一部としてSAS製品を提供することはなくなります。同時に、ライフサイエンス製品がJMPのみを使用するようにするための移行を実装する計画がすでに実施されていました。これらすべての考慮事項を考慮すると、これはこの決定を行うのに最適な時期です。
質問:この移行のメリットにはどのようなものがありますか?
回答:以前のJMP Genomics製品にはJMPフロントエンドがあり、バックエンドとしてSASを使用していました。そのため、いくつかの欠点がありました。
- 主にSASコンポーネントのために、大きなインストールパッケージ(12 GB)が必要だったため、インストールが困難でした。 現在、JMP Pro内のGenomicsを使用すると、ダウンロードが簡単で(1 GB未満)、インストールが高速です。
- ゲノミクスユーザーは、JMPの特別なバージョンを注文する必要がありました。 これで、JMP Pro内で必要な機能が利用できるようになり、別の製品やアドオンを入手する必要がなくなります。
- JMPには、インポートや一部の統計手法など、ゲノミクスデータの処理に必要なすべての機能がなかったため、以前のバージョンではSASが必要でした。 現在、JMPはSASを必要とせずにこれらのほとんどすべてのことを実行できます。
- ディスク上でSASデータセットを使用すると、ディスクアクセスが遅くなり、非圧縮ファイルが大きくなり、SASファイルとJMPファイルの不一致が発生しました。 JMP Proでは、ファイルははるかに小さく、圧縮された形式で、すべてのプラットフォームに直接アクセスでき、すべての分析はメモリ内で、はるかに高速になります。
- 以前は、ファイルを「背の高い」形式にスタックする必要があり、列が少なく、行数が膨大でした。 背の高い形式は無駄であり、主題データはその主題のすべての要素にわたって繰り返されていました。 「ワイド」形式の方がはるかに優れています。はるかにコンパクトであるだけでなく、JMP Proの多くの新機能を利用して、幅広いデータをすばやく簡単に処理できるようにします。
- 以前は数十万のカラムの処理が遅くなっていたJMPPro17のボトルネックを取り除きました。 現在、一般的に使用されているルーチンはマルチスレッド化され、幅広い問題に最適化されており、以前よりも数百倍高速になることもあります。
質問:現在のゲノミクスユーザーのニーズを満たし、ゲノミクスデータサイエンティストを引き付けるJMP Pro 17にはどのような機能がありますか?
回答:JMP Pro 17は、ゲノミクスデータの迅速なポイントアンドクリック探索、高度な多変量および予測モデリングツール、および柔軟で魅力的なユーザーエクスペリエンスの組み合わせを提供する、唯一の高度な分析ソフトウェアパッケージの1つです。適応型プラットフォーム(JMPスクリプティングおよび他のデータサイエンスツールとの統合による)。 このタイプの作業のためのJMPProの新機能は次のとおりです。
- いくつかのプラットフォームに対するパフォーマンスと出力の強化(応答スクリーニング、主成分、フィットモデル、ミックスフィット、階層クラスタリング、 K-Meansクラスタリング)大きくて幅の広いテーブルをより適切に処理する
- 2つの新しいプラットフォームを備えた新しい遺伝学サブメニュー:マーカー統計とマーカーシミュレーション
- 新しいでのt-SNEとUMAPを含む多変量次元削減と要約の方法多変量埋め込みプラットホーム
- イルミナIDATファイルの合理化されたインポート
- 多数のヒント、戦略、および一般的なゲノミクス分析ワークフローを提供する新しい詳細なトレーニング資料
ゲノミクスデータを分析するための従来のツールはプログラミングベースである傾向があり、プログラミング言語を学習するには長い学習曲線が必要でした。 JMP Proを使用すると、すべてがインタラクティブで、ポイントアンドクリックで、ウォークアップして簡単に使用できます。 すべてのグラフは完全にインタラクティブであり、分析は手がかりをたどり、グラフからの洞察を追求して、発見の旅になります。 これを、オープンソースツールを使用したプロセスを支配する、事前の学習負荷の高いスクリプトベースのワークプロセスと比較してください。 JMPを使用すると、研究者は分析ツールとの戦いにすべての時間を費やすのではなく、主題に集中することができます。プログラミングとスクリプトベースのスキルとツールをすでに持っている上級ユーザーにとって、JMP Proは彼らにとっても有益であり、データをすばやく理解して洞察をよりよく共有できるように、迅速なインタラクティブ分析を行うことができます。他の人と。
質問:ゲノミクスデータのJMP Pro 17分析は、同じユーザーエクスペリエンスを持ちますか、それとも異なりますか?
回答:Genomicsユーザー向けのJMP Pro 17の操作スタイルは、JMP Genomics製品とは異なります。事前に決定された分析ワークフローに適合するようにデータを再形成および特性化する代わりに、ユーザーは簡単なものに直接アクセスできます。 JMP Proのツールを使用して、独自のカスタムワークフローを作成します。
追加の質問はありますか?
他にご不明な点がございましたら、以下にコメントするか、Sam Gardner( @SamGardner )JMP製品管理。
新しいJMPGプラットフォームは、すべてのJMP Proユーザーが利用できますか?
@DonMcCormack JMP Proには、これらすべてのプラットフォームと機能が付属しています。
現在のJMPゲノミクスのゲノミクススターターの代わりに、新しいJMPプロにゲノミクスメニューはありますか?
JMPPro用の個別のゲノミクスメニューまたはゲノミクススターターはありません。2つの新しいプラットフォーム、MarkerStatisticsとMarkerSimulationがあり、Analyze.menuの下の別のサブメニューメニューにあります。