到現在為止，很多人都已經看到了最近的公告3 月 31 日之後，我們目前的 JMP Genomics 產品將不再向新客戶銷售英石。這個決定在內部引發了一些問題，當客戶聽到這個消息時，我們預期他們也會有類似的問題。 以下是其中一些問題以及開發和產品管理的答案。
Q：我們是否會放棄 JMP Genomics 客戶？「-omic」資料分析方法和工具仍然是我們產品願景和路線圖的重要組成部分嗎？
答案：不，我們不會放棄我們的客戶，是的，我們完全打算比以往更好地支援我們的 Genomics 和相關生命科學客戶 - 但現在使用 JMP Pro，而不是專門用於基因組學的單獨產品。 基因組學領域的用途和重要性正在不斷增長，而不僅僅是學術或基礎研究，我們預計我們當前和未來的客戶將希望使用我們的產品來解決該領域的重要問題。
問：為什麼我們現在要採取這項行動，而且速度如此之快？
答：JMP Pro 17 計畫的改進將提供先進等級的功能和性能，使其能夠獨立運行，而不需要 SAS 提供額外的分析功能。此外，我們現在必須開闢自己的道路，今年之後我們將不再提供 SAS 產品作為我們任何 JMP 產品的一部分。同時，我們已經制定了實施過渡的計劃，使我們的生命科學產品僅使用 JMP。考慮到所有這些因素，現在是做出這個決定的最佳時機。
問題：這種轉變會帶來哪些好處？
答：之前的 JMP Genomics 產品有一個 JMP 前端並使用 SAS 作為後端，因此有一些缺點：
- 安裝起來很困難，因為它需要一個很大的安裝包（12 GB），主要是因為 SAS 組件。 現在，借助 JMP Pro 中的 Genomics，可以輕鬆下載（小於 1 GB）且安裝快速。
- Genomics 使用者必須訂購特殊版本的 JMP。 現在，他們將在 JMP Pro 中擁有所需的功能 - 無需獲取不同的產品或附加組件。
- 先前的版本需要 SAS，因為 JMP 不具備處理基因組資料所需的所有功能，包括匯入和一些統計方法。 現在 JMP 幾乎可以完成所有這些事情，而無需 SAS。
- 在磁碟上使用 SAS 資料集會遇到磁碟存取速度慢、未壓縮檔案較大以及 SAS 和 JMP 檔案之間不匹配的問題。 在 JMP Pro 下，檔案將以壓縮形式變得更小，所有平台都可以直接訪問，並且所有分析都將在記憶體中進行，速度要快得多。
- 以前，文件通常必須堆疊成「高」的形式，列數很少，但行數很大。 高形式是浪費的，主題資料在該主題的所有元素中重複。 「寬」形式好得多；它不僅更加緊湊，而且利用 JMP Pro 中的許多新功能，使處理廣泛的資料變得快速、輕鬆。
- 我們消除了 JMP Pro 17 中的瓶頸，這些瓶頸之前導致處理數十萬列速度變慢。 常用的例程現在是多執行緒的，並針對廣泛的問題進行了最佳化，有時比以前快數百倍。
問題：JMP Pro 17 中有哪些功能和特性可以滿足當前 Genomics 用戶的需求並吸引基因組資料科學家？
答案：JMP Pro 17 將是唯一的高級分析軟體包之一，它提供了互動式和引人入勝的用戶體驗的組合，允許快速點擊式探索基因組數據、先進的多變量和預測建模工具以及靈活且自適應平台（透過JMP 腳本並與其他資料科學工具整合）。 JMP Pro 針對此類工作的新功能包括：
- 多個平台的效能和輸出增強（包括反應篩選,主要成分,適合模型,適合混合,分層的聚類, K 均值聚類) 更好地處理又大又寬的桌子
- 具有兩個新平台的新遺傳學子選單：標記統計和標記模擬
- 新的多變量降維和匯總方法，包括 t-SNE 和 UMAP多元嵌入平台
- 簡化 Illumina IDAT 檔案的匯入
- 新的詳細訓練教材提供了大量技巧、策略和常見的基因組學分析工作流程
用於分析基因組數據的傳統工具往往是基於程式設計的，需要較長的學習曲線來學習程式語言。 JMP Pro 的一切都是互動的、點擊式的、易於安裝和使用的。 所有圖表都是完全互動的，分析成為一次發現之旅，跟隨線索並從圖表中尋求見解。 將此與基於腳本的提前規劃、學習負擔重的工作流程進行對比，後者在開源工具的流程中占主導地位。 借助 JMP，研究人員可以專注於主題，而不是花費所有時間與分析工具作鬥爭。對於已經具備這些程式設計和基於腳本的技能和工具的高級用戶來說，JMP Pro 也將使他們受益，使他們能夠進行快速互動式分析，以便他們能夠快速了解自己的數據，並使他們能夠更好地分享自己的見解和他人。
問題：JMP Pro 17 基因組數據分析是否具有相同的使用者體驗，還是會有所不同？
答：面向 Genomics 使用者的 JMP Pro 17 的操作方式將與 JMP Genomics 產品不同：使用者將能夠直接存取簡單的數據，而不是重新調整和表徵數據以使其適合預先確定的分析工作流程。使用JMP Pro 中的工具並制定自己的自訂工作流程。
還有其他問題嗎？
如果您有任何其他問題，請隨時在下面發表評論或發送給 Sam Gardner ( @薩姆加德納）在 JMP 產品管理中。
@wendytseng我不確定針對許多列優化的確切項目。 或許@薩姆加德納從發展中就能發現。
關於以下好處…只有Pro版才有嗎？例如，在其他條件相同的情況下，JMP 與 JMP Pro 中的反應篩選效能是否會有所不同？
「我們已經消除了 JMP Pro 17 中的瓶頸，這些瓶頸之前導致數十萬列的處理速度變慢。常用的例程現在是多線程的，並針對廣泛的問題進行了最佳化，有時比前。”
@wendytseng ，據我所知，沒有一個清單。 最好指出我們可以做什麼，如果用戶想要的東西不存在，但他們在 JMP Genomics 中做過，那麼將其放入願望清單中。 JMP/JMP Pro 中沒有但 JMP Genomics 中有很多功能。 JMP Genomics 處理資料的方式可以在 JMP/JMP Pro 中完成，但需要採取多個步驟並結合一些不同的功能。
JMP Genomics 的哪些功能不是在 JMP Pro 中？（請告訴我此資訊是否存在於其他地方。）
我們不會為 JMP Pro 提供單獨的 Genomics 選單或 Genomics Starter。有兩個新平台：“標記統計”和“標記模擬”，它們位於“分析”選單下的單獨子選單中。
新 JMP Pro 上是否有 Genomics 選單，而不是目前 JMP Genomics 的 Genomics Starter？
@唐麥考馬克JMP Pro 將配備所有這些平台和功能。
新的 JMPG 平台是否可供所有 JMP Pro 使用者使用？
