到現在，很多人都看過最近的公告我們目前的 JMP Genomics 產品將在 3 月 31 日之後不再出售給新客戶英石.這一決定在內部引發了幾個問題，當客戶聽到這個消息時，我們預計他們也會有類似的問題。 以下是其中一些問題以及來自開發和產品管理的答案。
問題：我們是否要放棄我們的 JMP Genomics 客戶？“-omic”數據分析方法和工具是否仍然是我們產品願景和路線圖的重要組成部分？
答：不，我們不會放棄我們的客戶，是的，我們完全打算比以往更好地支持我們的基因組學和相關生命科學客戶 - 但現在使用 JMP Pro，而不是專門用於基因組學的單獨產品。 基因組學領域的使用和重要性正在增長，不僅僅是學術或基礎研究，我們預計我們當前和未來的客戶將希望使用我們的產品來解決該領域的重要問題。
問題：為什麼我們現在就採取行動，而且如此之快？
答：為 JMP Pro 17 計劃的改進將提供高級別的功能和性能，使其能夠獨立運行，而無需 SAS 提供額外的分析功能。此外，我們現在必須開闢自己的道路，今年之後我們將不再提供 SAS 產品作為我們任何 JMP 產品的一部分。與此同時，我們已經制定了實施過渡的計劃，以使我們的生命科學產品僅使用 JMP。考慮到所有這些因素，現在是做出此決定的最佳時機。
問題：這種轉變會帶來哪些好處？
答：之前的 JMP Genomics 產品有一個 JMP 前端並使用 SAS 作為後端，因此存在一些缺點：
- 它很難安裝，因為它需要一個大的安裝包（12 GB），主要是因為 SAS 組件。 現在，借助 JMP Pro 中的 Genomics，它易於下載（小於 1 GB）並且安裝速度很快。
- 基因組學用戶必須訂購特殊版本的 JMP。 現在，他們將在 JMP Pro 中擁有所需的功能 - 無需獲取不同的產品或附加組件。
- 以前的版本需要 SAS，因為 JMP 不具備處理基因組數據所需的所有功能，包括導入和一些統計方法。 現在 JMP 幾乎可以在不需要 SAS 的情況下完成所有這些事情。
- 在磁盤上使用 SAS 數據集會遇到磁盤訪問速度慢、未壓縮文件大以及 SAS 和 JMP 文件不匹配的問題。 在 JMP Pro 下，文件會更小，壓縮形式，所有平台都可以直接訪問，所有分析都將在內存中進行，而且速度要快得多。
- 以前，文件通常必須堆疊成“高”的形式，列數很少，行數很大。 高大的表格很浪費，主題數據在該主題的所有元素中重複。 “寬”形式要好得多；它不僅更緊湊，而且利用 JMP Pro 中的許多新功能來快速輕鬆地處理大量數據。
- 我們已經消除了 JMP Pro 17 中之前處理數十萬列速度緩慢的瓶頸。 常用的例程現在是多線程的，並針對廣泛的問題進行了優化，有時比以前快數百倍。
問題：JMP Pro 17 中將有哪些功能和特性可以滿足當前 Genomics 用戶的需求並吸引基因組數據科學家？
回答：JMP Pro 17 將是唯一的高級分析軟件包之一，它結合了交互式和引人入勝的用戶體驗，允許對基因組數據進行快速的點擊式探索，先進的多變量和預測建模工具，以及靈活的自適應平台（通過 JMP 腳本和與其他數據科學工具的集成）。 JMP Pro 針對此類工作的新功能包括：
- 對多個平台的性能和輸出增強（包括反應篩選,主成分,擬合模型,適合混合,分層的聚類, K-Means 聚類) 以更好地處理大而寬的桌子
- 帶有兩個新平台的新遺傳學子菜單：標記統計和標記模擬
- 一種新的多變量降維和匯總方法，包括 t-SNE 和 UMAP多元嵌入平台
- 簡化 Illumina IDAT 文件的導入
- 新的詳細培訓材料，提供大量提示、策略和常見的基因組學分析工作流程
用於分析基因組數據的傳統工具往往是基於編程的，需要很長的學習曲線來學習編程語言。 使用 JMP Pro，一切都是交互式的、點擊式的、簡單易用的。 所有的圖表都是完全交互的，分析變成了一次發現之旅，跟隨線索，從圖表中尋求洞察力。 將此與預先計劃學習負擔重的基於腳本的工作流程進行對比，後者使用開源工具主導該流程。 使用 JMP，研究人員可以專注於主題，而不是花費所有時間與分析工具作鬥爭。對於已經具備這些編程和基於腳本的技能和工具的高級用戶，JMP Pro 也將對他們有益，使他們能夠進行快速的交互式分析，以便他們能夠快速了解他們的數據並更好地分享他們的見解和其他人。
問題：JMP Pro 17 對基因組數據的分析會有相同的用戶體驗，還是會有所不同？
答：JMP Pro 17 for Genomics 用戶的操作方式將與 JMP Genomics 產品不同：用戶無需重新塑造和表徵您的數據以使其適合預先確定的分析工作流程，而是能夠直接訪問簡單的使用 JMP Pro 中的工具並製作自己的自定義工作流程。
還有其他問題嗎？
如果您有任何其他問題，請隨時在下面發表評論或發送給 Sam Gardner ( @SamGardner ) 在 JMP 產品管理中。
所有 JMP Pro 用戶都可以使用新的 JMPG 平台嗎？
@DonMcCormack JMP Pro 將配備所有這些平台和功能。
新 JMP Pro 上是否有 Genomics 菜單，而不是當前 JMP Genomics 的 Genomics Starter？
我們不會為 JMP Pro 提供單獨的 Genomics 菜單或 Genomics Starter。有兩個新平台，Marker Statistics 和 Marker Simulation，它們位於 Analyze.menu 下的單獨子菜單菜單中。
