확정 선별 설계에서 반복실험과 실패한 실행을 처리하는 방법커뮤니티 여러분, DSD에서 가져온 일부 데이터를 모델링하는 데 문제가 있습니다. 이것은 10가지 요소의 화면이었습니다. 우리는 이것을 3개의 블록(연산자)으로 실행했고 추가 실행의 최대 수(8)를 포함했습니다. 이것은 나에게 31 런의 테이블을 주었다. 우리는 모든 요소에 대한 합리적인 범위를 설정하기 위해 몇 가지 초기 범위 찾기 실험을 수행했습니다. 불행하게도 여전히 반응이 완전히 실패한 4개의 실행이 있으므로 응답으로 입력할 가치가 없습니다.
내 첫 번째 질문은 이러한 실패한 실행을 어떻게 처리해야 합니까? 이상적으로는 제외되어야 한다고 가정하고 여전히 데이터를 제공한 27개의 실행이 있을 것입니다. 하지만 테이블에서 제외하고 Fit Definitive Screening 스크립트를 실행하려고 하면 아무 일도 일어나지 않습니다. 오류 메시지는 없지만 창이 열리지 않습니다. 내 응답은 이 응답을 최소화하기 위한 목적으로 "완료 시간"이며 실험 기간보다 더 긴 시간을 나타내는 큰 숫자를 입력할 수 있지만 임의로 보입니다. 그래도 스크립트는 실행됩니다.
두 번째 질문은 모델에 대한 신뢰도를 높이기 위해 복제 실행을 포함할 수 있는지 여부입니다. 각 실행 조건에 대해 8회 반복 실행했습니다. 그러나 실행을 복사하여 붙여넣고 스크립트를 실행하려고 하면 아무 일도 일어나지 않습니다. 지금은 8회 실행의 평균을 취하고 그것을 사용하고 있지만 어떻게든 개별 값을 포함하는 것이 더 나은지 궁금합니다. 그렇다면 Fit Definitive Screening 스크립트로 수행할 수 있는 방법이 있습니까?
표준 Fit Model 모듈을 사용하여 이 두 가지 문제를 모두 해결할 수 있지만 DSD의 이점을 놓치고 있는 것 같습니다. 응답해 주셔서 감사합니다! 저는 JMP 15.2를 사용하고 있습니다. 테이블을 게시하는 것이 도움이 된다면 기꺼이 하겠습니다.
데이터 혼합 및 정리실험 설계Re: 확정 선별 설계에서 반복 실험과 실패한 실행을 처리하는 방법천만에요. 실험적 디자인은 많은 "측면"을 가진 거대한 주제입니다. 주제를 더욱 복잡하게 만드는 것은 하나의 "올바른 방법"이 없다는 것입니다. 일부는 더 효율적이고 일부는 더 효과적입니다. 나는 먼저 상황을 이해해야 하고, 내가 대답하려는 질문이 무엇인지, 통찰력을 얻고자 하는 가설이 무엇인지, 어떤 모델 효과를 추정해야 하는지를 이해해야 한다는 것을 알게 되었습니다. 저는 여러 옵션/계획을 설계하고 각 옵션에 대해 잠재적으로 얻을 수 있는 지식(실제로 가능한 모든 결과를 예측함)을 생각하고 리소스 요구 사항과 비교 평가합니다. 내가 반복할 것임을 인식하고 조사를 계속하려면 무엇이 필요합니까?
나는 운이 좋게도 몇몇 최고의 지성인들(Box, Taguchi, McLean, Sanders, Diamond, Bisgaard 등)로부터 배울 수 있었고 1000건의 실험을 설계하고 분석하는 일에 참여하는 사치를 누렸습니다. 회고전의 많은 마녀가 더 잘 디자인되었을 수 있습니다 ... LOL
Re: 확정 선별 설계에서 반복 실험과 실패한 실행을 처리하는 방법더 많이 배울수록 내가 얼마나 모르는지 더 많이 깨닫게 됩니다. 지속적인 지도 감사합니다!
Re: 확정 선별 설계에서 반복 실험과 실패한 실행을 처리하는 방법앞으로는 실행할 디자인을 선택하기 전에 어떤 모델 효과를 분리하고 싶은지, 어떤 모델 효과를 혼란에 빠뜨리고 싶은지, 어떤 모델 효과를 연구에 포함하고 싶지 않은지 아는 것이 좋습니다!
반응 표면 매크로를 사용할 수 없으며 블록이 무작위 효과가 아닌지 확인해야 합니다. 모델을 생성하려면 사용 가능한 전체 자유도와 실험의 앨리어싱을 이해해야 합니다. (모델에 별칭 항을 넣지 마십시오. 특이점 오류가 발생합니다.) 여기에서 시작할 수 있습니다.
https://www.jmp.com/support/help/en/16.2/?os=mac&source=application&utm_source=helpmenu&utm_medium=application#page/jmp/effective-model-selection-for-dsds.shtml#ww292566
JMP에서 디자인을 만들 때 디자인 평가 스크립트인 화살표를 가져와야 합니다. 그러면 앨리어싱 구조가 제공됩니다. 전체 블록을 실행한 경우 모델에는 최종 선별 디자인 모델, 블록 및 모든 블록별 최종 선별 모델 효과가 포함됩니다.
Re: 확정 선별 설계에서 반복 실험과 실패한 실행을 처리하는 방법statman에게 감사합니다. 접근 방식을 이해하는 것 같습니다.
포화된 모델을 생성하기 위해 모든 요인, 모든 요인의 제곱 및 모든 상호 작용(반응 표면 매크로 사용)으로 시작했습니다. 그런 다음 Standard Least Squares를 실행합니다. 블록을 고정 효과로 취급하는 옵션이 있습니까? 현재 결과에는 모든 상호 작용에 대한 p 값을 얻지 못하는 것으로 보이는 몇 가지 특이점이 나열됩니다. 거기에 갇혀있어. 귀하의 모델에는 모든 요소와 몇 가지 상호 작용이 있지만 전부는 아닙니다. 이는 이미 모델을 축소했음을 의미합니까? 어떤 것을 제거해야 하는지 어떻게 알았습니까?
Re: 확정 선별 설계에서 반복 실험과 실패한 실행을 처리하는 방법DOE 데이터를 분석할 때 내 사고 과정은 포화된 모델로 시작하는 것입니다. 이것은 빼기 모델 구축에 대한 접근 방식(vs. 단계별 접근 방식과 같은 추가 접근 방식). 포화 모델은 모든 자유도가 할당된 경우입니다. 귀하의 경우 블록을 고정 효과로 취급하고 블록별 상호 작용을 포함합니다. 결과를 분석할 때 먼저 각 요인(모형 항)이 어떤 실질적인 영향을 미치는지 생각한 다음 통계적 유의성을 살펴봅니다. 중요하지 않은 항목을 제거한 다음 축소된 모델을 다시 실행하고 잔차를 분석합니다. 귀하의 데이터 세트에 실질적인 중요성이 무엇인지 모르기 때문에 모델을 축소할 수 없습니다.
Re: 확정 선별 설계에서 반복 실험과 실패한 실행을 처리하는 방법안녕 @statman , 모든 데이터와 블록을 효과로 포함하여 제공한 모델은 우리가 시스템에 대해 알고 있는 것에서 의미가 있습니다. 저는 귀하의 모델을 재생성하려고 노력했지만 어려움을 겪고 있습니다. 특히 요인의 하위 집합(pH, Mg, Log2X2, Log25X3)에 대한 2차 상호 작용 및 2차 효과를 살펴보는 데 어떻게 정착했는지 잘 모르겠습니다. 우리가 기대했던 좋은 곡률.
나는 전략을 시도했다 @P_Bartell 위에서 언급한 - 주요 효과를 선별한 다음 모든 가능한 요인 조합과 교차합니다. 또한 몇 가지 다른 방법으로 단계별 선형 회귀를 사용해 보았습니다. 그러나 당신이 제공한 것만큼 예측할 수 있는 것은 없었습니다. 어떻게 거기에 도달했는지 알고 싶습니다. 당신의 사고 과정에 대한 통찰력이 있으면 감사하겠습니다! 또는 읽어야 할 특정 도움말 페이지가 있으면 알려주십시오.
Re: 확정 선별 설계에서 반복 실험과 실패한 실행을 처리하는 방법감사합니다 @statman ! 나는 DOE 모델링에 상당히 익숙하지 않기 때문에 당신이 스크립팅한 모델에 대한 나만의 방법을 찾으려고 노력하지만 고정 효과로 블록이 있는 전체 데이터 세트를 사용하는 데 집중하고 있으며 복제 데이터를 포함하는 것이 도움이 되는 것 같습니다. 개별 블록 모델 간의 차이점은 확실히 우려됩니다. 도움을 주신 모든 분들께 감사드립니다.
Re: 확정 선별 설계에서 반복 실험과 실패한 실행을 처리하는 방법블록별로 몇 가지 분석(적합 모델)을 실행하고 블록을 고정 효과로 포함했습니다. 첨부 데이터 시트. 분석은 포화 모델을 사용하고 있으며 축소되지 않았습니다. 예, 블록 효과는 상당히 어려울 수 있습니다... 많은 질문으로 이어집니다.
Re: 확정 선별 설계에서 반복 실험과 실패한 실행을 처리하는 방법5분 이상이면 관심 대상이 됩니다. 3개의 블록/운영자에 대한 "중간점" 분석의 경우 16, 25, 25분 만에 완료되었습니다(이는 그 자체로 한 명의 운영자가 훨씬 더 빨랐다는 점에 약간의 우려가 있음).
이러한 조건의 대부분은 그보다 훨씬 더 나쁩니다. 하지만 우리는 그 시기를 개선하는 데 도움이 될 수 있는 요소를 식별하기를 바랐습니다.
Re: 확정 선별 설계에서 반복 실험과 실패한 실행을 처리하는 방법빠른 질문: 시간의 변화가 얼마나 과학적으로 중요합니까(또는 실제적으로 중요합니까)?
Re: 확정 선별 설계에서 반복 실험과 실패한 실행을 처리하는 방법안녕 @Mark_Bailey , @statman , @P_Bartell ,
생각해주셔서 감사합니다! 도움이 된다면 내가 보고 있는 것을 복제할 수 있도록 내 데이터 테이블을 첨부했습니다. 지금은 "시간" 열에 값이 없는 셀이 실패한 실행입니다. 값이 없으면 Fit Definitive Screen 스크립트가 실행되지 않습니다. 해당 행/실행을 제외해도 스크립트는 여전히 실행되지 않습니다. 임의의 값을 할당하면 실행됩니다. 실행을 제외하지 않는 것이 최선이며 이것이 모델에 해를 끼칠 것이라는 것을 알고 있지만 테이블을 생성할 때 8개의 추가 실행을 추가했기 때문에 실패로 4개를 잃어도 여전히 작동할 수 있기를 바랐습니다. 스크립트가 시도조차 하지 않는다는 사실에 놀랐습니다! 나는 접근 방식을 시도함으로써 시작했습니다. @P_Bartell 제안했고 거기에도 질문이 있지만 그것은 아마도 다른 스레드여야 하며 먼저 그것에 대해 더 많은 시간을 할애하고 싶습니다. 다른 질문에 답하려면 다음을 수행하십시오.
- 예, "완료 시간"이 아닌 다른 메트릭을 사용해 볼 수 있습니다. 내가 생각할 수 있는 유일한 것은 "실험에 남은 시간"이고 그 값을 최대화하려고 시도합니다(실패한 실행의 경우 0이 됨). 이것은 최대에 도달할 때까지 시간이 지남에 따라 증가해야 하는 신호를 생성하는 생화학 반응입니다. 실패한 실행에서는 신호가 생성되지 않았으므로 사용할 다른 값이 없습니다.
- 실험 기간보다 큰 숫자 또는 매우 큰 숫자(작동하지 않았기 때문에 무한대 시간 근사치)와 같이 실패한 실행에 값을 할당하려고 시도했습니다. 이러한 값은 실제로 모델을 왜곡하고 모든 다른 데이터 포인트는 덜 영향을 미칩니다.
- 명확히 하기 위해 내 복제는 실제로 동일한 실행의 여러 측정이 아니라 실행 조건의 반복입니다. 따라서 총 31*8 = 248개의 반응을 실행했습니다. 이러한 반응은 자연적으로 약간의 가변성을 가지므로 복제가 중요합니다. 현재 표에 있는 값은 8회 실행의 평균입니다. 모델의 각 실행에서 데이터를 포함하는 데 어느 정도 가치가 있을 것이라고 생각했지만 테이블에 추가 실행을 추가하려고 하면 Fit Definitive Screening 스크립트가 실행되지 않습니다.
- "실패에서 배운 점"을 다루기 위해: 실패한 실행을 보면 4개 중 3개가 낮은 Mg와 높은 Log2X1의 조합을 가집니다. 이는 반응에 악영향을 미칠 것으로 예상되었고, 이 조합을 사용할 수 없도록 제약 조건을 설정하는 것을 고려했지만 DSD에서 허용하지 않았습니다. 사용자 지정 DOE를 수행했다면 이 제약 조건을 만들었을 것입니다. (Low Mg 및 High Log2X1이 작동하는 경우가 있으므로 이것이 보장된 실패는 아닙니다.)
지금은 Fit Definitive Screening 스크립트를 사용하지 않고 개별 복제 데이터를 포함하여 실패한 실행을 제외하여 이 데이터를 모델링하려고 합니다.
Re: 확정 선별 설계에서 반복 실험과 실패한 실행을 처리하는 방법Fit Definitive Screening이 수행하는지 확인하고 싶습니다. ~ 아니다 누락된 값이 있거나 확정 선별 설계에서 실행을 삭제 또는 제외한 경우 작동합니다. 전문 분석은 다음에 따라 다릅니다. 접이식 구조 분석을 위한 모델 행렬을 형성할 때 설계 행렬의 (다음과 함께 Fit Definitive Screening을 사용할 수 있습니다. 어느 접을 수 있는 디자인!)
반응이 없는 실행에 대해 누락된 값을 완료 시간에 대해 매우 큰 숫자로 대체할 수 있는지 궁금합니다. 이 기록은 숫자 트릭입니다. 일부 실행이 본질적으로 무한한 시간이 걸리는 분석을 진행하기를 원하지만 이를 유한한 숫자로 나타냅니다. 예를 들어 반응 시간이 5분에서 2시간 범위인 경우 결측값 대신 1000에서 100000의 값을 사용할 수 있습니다. 작동합니까? 나는 당신의 실험을 가능한 한 많이 되찾기 위해 노력하고 있습니다.
추가 실행이 실제로 복제됩니까? 즉, 단순히 단일 실행의 반복 측정이 아닙니다. Time to Completion에서는 실제 복제본이어야 합니다. 확인만 하면 됩니다. 그렇다면 나는 확실히 개별 반복을 포함하고 평균을 포함하지 않을 것입니다. 그러나 반대 주장은 평균과 표준 편차를 추정하고 이를 모델링하여 최소 평균 시간과 시간의 최소 변동을 모두 제공하는 조건을 찾을 수 있다는 것입니다.
나의 마지막 의견은 Fit Definitive Screening이 훌륭하고 전문화된 도구라는 것입니다. 그것은 실제로 모델 선택에 관한 것이며 그것이 진행되는 한입니다. 최상의 선형 모델을 선택하기 위한 다른 많은 도구가 있습니다.
Re: 확정 선별 설계에서 반복 실험과 실패한 실행을 처리하는 방법내 생각:
1. 응답 변수: "완료 시간" 이외의 것을 측정할 수 있습니까? 예를 들어, 완료율 또는 'x' 시간 후 화학....즉, 현상을 측정하는 다른 방법입니다.
2. 이것은 최적성을 염두에 둔 모든 DOE 전략의 관심사입니다. 손실/누락/비정형 데이터에 더 취약합니다.
3. 누락된 데이터를 대체하는 방법(이에 대한 몇 가지 아이디어가 있지만 누락된 데이터가 많을수록 유용성이 떨어짐)?
- 데이터 세트의 평균 사용
- 예측 데이터 사용(이러한 예측이 선험적으로 이루어졌으면 합니다.
- 가지고 있는 데이터를 회귀하고 모델을 사용하여 누락된 데이터를 예측합니다(적합 모델 플랫폼 사용).
- 위의 모든 작업을 수행하고 결과를 비교합니다....어느 정도 동의하면 결과 분석에 더 큰 확신을 갖게 됩니다. 그렇지 않으면 무엇을 배웠고 다음 반복은 무엇인지 결정해야 합니다.
4. "각 실행 조건에 대해 8번의 반복 실험을 실행했습니다."라는 말이 약간 혼란스럽습니다. 복제 또는 반복? 그들은 독립적인 치료였습니까? 실제로 복제이고 8개의 모든 복제가 반응하지 않은 경우(4회) 무엇을 배웠습니까?
Re: 확정 선별 설계에서 반복 실험과 실패한 실행을 처리하는 방법첫째, 귀하의 데이터를 보지 않았기 때문에 귀하가 설명하는 고장 모드를 복제할 수 없습니다...하지만 운이 없는 것 같습니다. DSD의 기능을 활용하려면 각 치료 조합에 대한 모든 응답이 있어야 합니다. Fit Definitive Screening 스크립트에 규정된 2단계 분석을 위한 매우 경제적이고 정보가 풍부한 디자인입니다. 여기 내 일반적인 제안이 있습니다. 다시 한 번 귀하의 데이터를 살펴보지 않았습니다. 하지만 최소한 시도해 볼 수는 있습니다... DSD 분석 워크플로에서 도달한 것과 동일한 결론으로 돌아갈 수 있습니다.
Fit Model 플랫폼을 사용해야 합니다. 모든 복제를 '있는 그대로' 포함합니다. 또한...통계적이거나 실제적인 포인트 사이의 변동에 유용한 정보가 있을 수 있습니다. DSD 분석 워크플로는 DSD 접근 방식의 이점을 실현하기 위해 효과 희소성을 가정하기 때문에...주 효과만 모델에 맞추는 것으로 시작하여 어떤 효과가 활성화되는지 확인하겠습니다. 누락된 치료 조합이 이러한 활성 주요 효과를 찾는 데 너무 많은 상처를 입히지 않기를 바랍니다. 이러한 활성 주효과를 얻은 후에는 활성 주효과와 해당 주효과 항을 포함하여 가능한 모든 두 요인 상호 작용을 사용하여 모형을 적합합니다. 해당 모델에 맞는... 그리고 그것이 당신에게 무엇을 말하는지 보십시오.
이 2단계 접근 방식은 Fit Definitive Screening 분석 플랫폼이 하는 일을 개념적으로 모방합니다. 이 접근 방식이 당신을 가깝게 만들 수 있다고 생각합니까?
나는 다른 사람들이 무엇을 보는지 관심이 있습니다. @Mark_Bailey 또는 @statman 생각할지도 모른다?
Re: 확정 선별 설계에서 반복실험 및 실패한 실행을 처리하는 방법안녕하세요 @Mark_Bailey
이어서 DSD에 개별 복제물을 어떻게 입력합니까? DOE의 표를 설계할 때 반복실험 횟수를 나타내는 상자가 없습니다(예를 들어 고전적인 선별 설계를 설계할 때는 이 상자가 나타납니다).
감사합니다
사라
Re: 확정 선별 설계에서 반복실험 및 실패한 실행을 처리하는 방법DSD에는 동일한 옵션이 없습니다. 확정 선별 적합치를 사용하려는 경우 일부 실행을 복제할 수 없습니다. 테이블 만들기를 클릭한 후 모든 실행을 복사하고 원본 행 아래에 복사본을 붙여넣어 디자인을 복제할 수 있습니다.
Re: 확정 선별 설계에서 반복실험 및 실패한 실행을 처리하는 방법안녕하세요 @SaraA 님 ,
@Mark_Bailey가 언급했듯이 DSD에 속한 모든 행을 복사하여 붙여넣어 전체 디자인을 수동으로 복제할 수 있습니다.
Augment Design 플랫폼을 사용하여 DSD를 복제할 수도 있습니다. 디자인 복제
