Anpassungsmodellierung des Bakterienzellwachstums mit gestapelten DatenIch bin ein absoluter JMP-Neuling und habe mich gefragt, ob es eine Möglichkeit gibt, eine Bakterienwachstumskurve (sigmoidal) anzupassen, um die Wachstumsrate zu extrahieren. Normalerweise mache ich das, indem ich die Kurve in Excel zeichne, die Punkte auswähle, die dem exponentiellen Wachstum entsprechen (die Mitte der Kurve), diese auf einer logarithmischen Y-Achse zeichne und eine exponentielle Anpassungstrendlinie hinzufüge. Der Exponentialkoeffizient in der Trendliniengleichung entspricht der Wachstumsrate, die ich brauche. Ich muss diesen Vorgang dann für jedes Replikat der Wachstumskurve wiederholen, das ich habe, und dann berechne ich schließlich manuell die Standardabweichung zwischen den Replikaten.
Ich habe mit JMP herumgespielt und mir das nichtlineare 4p-Anpassungsmodell für Zellwachstum angesehen, und der Zellteilungsaspekt der Gleichung scheint ungefähr mit meinen manuell berechneten Wachstumsraten zu korrelieren, bin mir aber ehrlich gesagt nicht sicher, ob sie gleich sind Ding oder nicht. Außerdem finde ich keine Möglichkeit, drei gestapelte Replikatkurven anzupassen. Immer wenn ich sie zeichne und „Mittelwert“ als zusammenfassende Statistik wähle, versuche ich, die gemittelten Kurven zu modellieren, und im neuen Fenster, das erscheint, werden alle drei Kurven separat angezeigt. Jede Hilfe wäre dankbar! TIA!
Datenmischung und -bereinigungMac OSBetreff: Anpassungsmodellierung des Bakterienzellwachstums mit gestapelten DatenHallo @PriorChipmunk23 ,
Hier ist eine Möglichkeit, die Ihnen helfen könnte:
In „Fit Curve“ können Sie das nächstgelegene Modell finden (wie Sie es bereits getan haben) und die parametrische Vorhersageformel speichern:
Anschließend können Sie zur nichtlinearen Plattform wechseln und diese Formel als Prädiktor und Ihre Ausgabevariable als Y verwenden. Klicken Sie auf „Los“, um den Anpassungsprozess zu starten. Anschließend können Sie die Vorhersageformel, den Standardfehler, Formeln für Konfidenzgrenzen oder nur die Grenzwerte speichern:
Wenn Sie dies stapelweise tun möchten, fügen Sie einfach die Spalte mit der Stapel-ID in das „By“-Fenster im Startdialog ein. Es werden dann so viele passende Dialoge gestartet, wie Ebenen in Ihrer Batch-ID-Spalte vorhanden sind.
Hoffe das hilft!
Florian
