Anpassungsmodellierung des Bakterienzellwachstums mit gestapelten DatenIch bin ganz neu bei JMP und habe mich gefragt, ob es eine Möglichkeit gibt, eine Bakterienwachstumskurve (sigmoidal) anzupassen, um die Wachstumsrate zu extrahieren. Normalerweise mache ich das, indem ich die Kurve in Excel zeichne, die Punkte auswähle, die dem exponentiellen Wachstum entsprechen (die Mitte der Kurve), diese auf einer logarithmischen Y-Achse zeichne und eine Trendlinie mit exponentieller Anpassung hinzufüge. Der Exponentialkoeffizient in der Trendliniengleichung entspricht der Wachstumsrate, die ich brauche. Ich muss diesen Vorgang dann für jede Wiederholung der Wachstumskurve wiederholen, die ich habe, und dann berechne ich schließlich manuell die Standardabweichung zwischen Wiederholungen.
Ich habe mit JMP herumgespielt und mir das nichtlineare 4p-Fit-Modell für das Zellwachstum angesehen, und der Zellteilungsaspekt der Gleichung scheint ungefähr mit meinen manuell berechneten Wachstumsraten zu korrelieren, aber ich bin mir ehrlich gesagt nicht sicher, ob sie gleich sind Sache oder nicht. Außerdem kann ich keine Möglichkeit finden, drei gestapelte Wiederholungskurven anzupassen. Immer wenn ich sie zeichne und "Mittelwert" als zusammenfassende Statistik auswähle, versuche ich dann, die gemittelten Kurven zu modellieren, und das neue Fenster, das sich öffnet, hat alle drei Kurven als getrennt. Jede Hilfe wäre willkommen! TIA!
AnalytikDatentabelleGrafikMac OSBetreff: Anpassungsmodellierung des Bakterienzellwachstums mit gestapelten DatenHallo @ PriorChipmunk23 ,
Hier ist eine Möglichkeit, die Ihnen helfen könnte:
In Fit Curve können Sie das nächstgelegene Modell finden (wie Sie es bereits getan haben) und die parametrische Vorhersageformel speichern:
Sie können dann zur nichtlinearen Plattform wechseln und diese Formel als Prädiktor und Ihre Ausgabevariable als Y verwenden. Klicken Sie auf „Los“, um den Anpassungsprozess zu starten, und dann können Sie Vorhersageformeln, Standardfehler, Formeln für Vertrauensgrenzen oder nur die Grenzwerte speichern:
Wenn Sie dies chargenweise tun möchten, setzen Sie einfach die Spalte mit der Batch-ID in das „By“-Fenster im Startdialog. Es werden dann so viele passende Dialoge gestartet, wie Sie Ebenen in Ihrer Chargen-ID-Spalte haben.
Hoffe das hilft!
Florian
