Modelado de ajuste de crecimiento de células bacterianas con datos apiladosSoy muy nuevo en JMP y me preguntaba si hay una manera de ajustar una curva de crecimiento bacteriano (sigmoidal) para extraer la tasa de crecimiento. La forma en que generalmente hago esto es trazando la curva en Excel, eligiendo los puntos que corresponden al crecimiento exponencial (la mitad de la curva), trazando esos en un eje y de escala logarítmica y agregando una línea de tendencia de ajuste exponencial. El coeficiente exponencial en la ecuación de la línea de tendencia corresponde a la tasa de crecimiento, que es lo que necesito. Luego tengo que repetir ese proceso para cada réplica de la curva de crecimiento que tengo y finalmente calculo manualmente la desviación estándar entre las réplicas.
He estado jugando con JMP y analicé el modelo de ajuste no lineal 4p de crecimiento celular y el aspecto de división celular de la ecuación parece correlacionarse aproximadamente con mis tasas de crecimiento calculadas manualmente, pero honestamente no estoy seguro de si son lo mismo cosa o no. Además, no puedo encontrar una manera de ajustar tres curvas replicadas que se han apilado; cada vez que los represento y selecciono "media" como la estadística de resumen, intento modelar las curvas promediadas y la nueva ventana que aparece tiene las tres curvas separadas. ¡Cualquier ayuda sería apreciada! ¡TIA!
AnalíticaTabla de datosGráficosMac OSRe: Modelado de ajuste de crecimiento de células bacterianas con datos apiladosHola @PriorChipmunk23 ,
Aquí hay una manera que podría ayudarte:
En Ajustar curva puede encontrar el modelo más cercano (como ya lo hizo) y guardar la fórmula de predicción paramétrica:
Luego puede ir a la plataforma no lineal, usando esta fórmula como predictor y su variable de salida como Y. Presione "Ir" para iniciar el proceso de ajuste y luego podrá guardar la fórmula de predicción, el error estándar, las fórmulas para los límites de confianza o simplemente los valores límite:
Si desea hacer esto por lotes, simplemente coloque la columna con el ID de lote en la ventana "Por" en el diálogo de inicio. Luego lanzará tantos diálogos apropiados como niveles tenga en su columna de ID de lote.
¡Espero que esto ayude!
florián
