Descripción general
La Universidad de Cornell brinda una definición simplificada del objetivo principal de la industria de la biotecnología: utilizar enzimas, microorganismos y plantas para generar energía, productos químicos y bienes de consumo, junto con avances tecnológicos en genómica, biocombustibles, análisis de datos y automatización. En otras palabras, la industria crea procesos y manipula productos para promover el descubrimiento con el objetivo de mejorar la calidad del producto y el rendimiento.
Desafíos
La gran cantidad de datos involucrados en la investigación biofarmacéutica ha creado la necesidad de herramientas analíticas sólidas que puedan administrar simultáneamente una gran cantidad de datos y, al mismo tiempo, proporcionar una interfaz interactiva y fácil de usar que facilite la colaboración entre expertos con una variedad de conocimientos estadísticos.A menudo, los usuarios tienen contenido en varios lugares, lo que dificulta el intercambio de datos.JMP les ayuda a mejorar la eficiencia entre equipos al permitir que los usuarios compartan rápidamente sus descubrimientos. El conjunto de productos JMP de JMP estándar, Pro, Live, Clinical y Genomics realmente promueve la sinergia dentro de una empresa para colaborar en un descubrimiento adicional en cada campo.
Los investigadores necesitan complementar su conocimiento de la materia con análisis de datos para tomar decisiones más rápidas y mejor informadas a partir de los datos existentes y para resolver problemas correctamente la primera vez.Necesitan un análisis efectivo para eliminar fallas altas o aspectos de alto costo para capturar más valor y reducir el desperdicio.En una industria donde las decisiones de diseño tienen un impacto significativo en el costo, los científicos necesitan enfoques más eficientes para optimizar el desarrollo de procesos biofarmacéuticos.
¿Por qué JMP?
El análisis de datos de JMP permite a algunas de las empresas farmacéuticas y biotecnológicas más grandes e innovadoras del mundo explorar los procesos y los datos de laboratorio, comprender las fuentes de las variaciones del proceso, aprender más de las investigaciones de la causa raíz y optimizar los procesos y el diseño experimental, todo sin aprender código. En resumen, JMP ahorra tiempo y dinero y puede ser utilizado por cualquier nivel de empleado de la industria.
¿Quién usa JMP?
- Científico
- I+D
- bioestadísticos
- epidemiólogo
Solicitud de JMP s en la Industria Biotecnológica
Los miembros de nuestro equipo conversaron con Tom Tao, quien actualmente es el ingeniero de sistemas del equipo HLS (ciencias de la salud y la vida) de China. Compartió información sobre cómo la industria biotecnológica aplica JMP y JMP Clinical durante dos etapas distintas del desarrollo de fármacos:
Nivel 1 : Antes de IND (Solicitud de nuevo fármaco en investigación)
- Pruebas de hipótesis: como probar la eficacia de lotes nuevos y antiguos de medicamentos
- DOE: una parte integral del enfoque Quality by Design (QbD), aplicado en el desarrollo de productos biológicos tanto para procesos como para métodos analíticos
- Modelado: ayuda a la plataforma JMP DOE a determinar los resultados óptimos de la producción biológica
Etapa 2 : Después de IND – Comercialización y Producción en Masa
- a) SPC (Statistical Process Control): utilizado para estabilizar y controlar la calidad de la producción de medicamentos
- b) Confiabilidad: análisis de estabilidad y vida útil
Tom también brinda una imagen de las plataformas en JMP que se usan con mayor frecuencia para ayudar en todo el proceso de investigación y producción de la mayoría de los clientes de la industria de la biotecnología. Este gráfico también se usa con frecuencia en las demostraciones de preventa del equipo de China HLS, especialmente cuando las audiencias son de la industria biotecnológica, de investigación clínica y farmacéutica para mostrar cómo JMP apoya la idea de QbD (calidad por diseño) aplicada en la industria biotecnológica.

Empresas de la industria que utilizan JMP
Merck (Pharmaceutical) se enfrentó al desafío de acelerar los avances en la investigación de biomarcadores al implementar métodos estadísticos para explotar datos oncológicos cada vez más sofisticados. Sus bioestadísticos utilizan funciones interactivas en JMP® para realizar análisis estadísticos sólidos en menos tiempo. La interfaz accesible de JMP facilita que los expertos en estadística colaboren con expertos en la materia.
https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/merck.html
Medtronic analiza datos para crear y estudiar pruebas de laboratorio que ayudan a crear dispositivos eficientes y precisos. Su Equipo de Investigación y Desarrollo utiliza grandes conjuntos de datos y análisis estadísticos para determinar las variables que más afectan el rendimiento de un dispositivo. Por ejemplo, la tecnología LigaSure es una serie de dispositivos destinados a hacer que la cirugía sea más segura. Utilizando JMP, los dispositivos desarrollados pueden encontrar la cantidad óptima de presión y energía de radiofrecuencia para volver a conectar los vasos sanguíneos durante la cirugía. Esto ha llevado a minimizar la pérdida de sangre y disminuir los tiempos de recuperación de los pacientes.
https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/medtronic.html
fuji película Diosynth Biotecnologías desarrolla y ofrece procesos de fabricación de principios activos para empresas farmacéuticas. Enfrentaban el desafío de que, en una industria donde las decisiones de diseño tienen un impacto significativo en el costo, los científicos necesitan enfoques más eficientes para optimizar el desarrollo de procesos biofarmacéuticos. Al introducir JMP Pro en el sistema, el diseño de experimentos a medida (DOE) ayuda a optimizar la experimentación y acortar los tiempos de desarrollo. Además, Functional Data Explorer (FDE), como herramienta de transformación de datos, ayuda a los científicos a preparar datos para el análisis, incluido el DOE. Los tableros de JMP en formato HTML también se pueden compartir con usuarios que no son de JMP.
https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/fujifilm-diosynth-biotechnologies.html
Las historias de ventas ganan
Soluciones 25:2
25:2 Solutions se especializa en el uso de Machine Learning para ayudar a las empresas a desarrollar nuevos y mejores cultivos. Originalmente compró JMP Genomics para un usuario ($12.6k) y desde entonces ha actualizado (agregando otros $3k) y renovado cada licencia desde entonces.
“JMP Genomics nos ha ayudado a acelerar el desarrollo de líneas y variedades de mejoramiento”, dice el genetista y CTO de 25:2 Solutions Eric Jackson. Sin embargo, el ahorro de tiempo no es la única ventaja. Jackson dice que lo más importante es la evolución constante de la herramienta a medida que los desarrolladores de software de JMP escuchan las necesidades de los usuarios para diseñar y desarrollar nuevas funciones.
https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/25-2-solutions.html
Pfizer
Pfizer, la segunda compañía farmacéutica más grande del mundo, firmó el jueves un contrato por 30 licencias de JMP Clinical en un acuerdo valorado en casi $100,000. Pfizer utilizará el software para revisiones de datos clínicos y la creación de narraciones de pacientes mientras prueba una nueva clase de medicamentos para reducir el colesterol dirigidos a una enzima conocida como PCSK9. “Hay una gran carrera entre las compañías farmacéuticas para ver quién será el primero en comercializarlo”, explicó David Schultz. "Es uno de los proyectos de mayor prioridad en Pfizer en este momento en la etapa clínica".
A finales del año pasado, el equipo de JMP hizo una presentación inicial al grupo de Pfizer responsable de la revisión y análisis de datos clínicos. Una evaluación de software comenzó a mediados de 2014. A fines de agosto, el campeón de JMP en Pfizer hizo una demostración de JMP Clinical a los médicos que utilizarían el software. David recordó que durante la presentación, “el líder clínico silenció el teléfono y le dijo al campeón: '¿Cuándo podremos obtener este software? Es exactamente lo que necesitamos'”. Siguió un tortuoso proceso de adquisición, con recortes presupuestarios que a veces hacían que la compra pareciera poco probable.
Eventualmente, el director sénior de análisis de datos e informes “dio un paso al frente y descubrió cómo hacer que sucediera”, dijo David. Tanto él como Doug Robinson le dieron crédito a Kelci Miclaus por ayudar a asegurar el éxito del acuerdo. “Kelci dedicó gran parte de su tiempo a trabajar con Pfizer y ayudarlos durante la evaluación”, dijo David. “Se trabajó mucho para demostrar que JMP Clinical podría leer los datos del estudio PCSK9”. Suponiendo que este proyecto piloto tenga éxito, Pfizer “será una cuenta muy especial para JMP”, dijo David. “Tener a Pfizer usando JMP Clinical es muy, muy significativo. Pasando al próximo año, hay un maravilloso potencial de crecimiento”.
- Producto: JMP Clinical
- Monto: $98,971
- Actores integrales: Dan Durkin, Mary Loveless, Geoff Mann, Kelci Miclaus, Doug Robinson, David Schultz, Jon Weisz
Re Levante Delaware mes Recursos
JMP, JMP Pro, JMP Clinical y JMP Genomics se utilizan ampliamente para ayudar en el proceso de modelado y exploración de datos en la producción biológica. Nuestro equipo investigó la biblioteca de referencia técnica y encontró dos demostraciones y un seminario web disponibles.
Tomamos una de dos demostraciones: fermentación de etanol y el conjunto de datos "Ferm at Age 32 hrs", como ejemplo. La fermentación de etanol (también conocida como fermentación alcohólica) es un proceso biológico que convierte los azúcares (glucosa, fructosa, sacarosa) en energía celular, produciendo etanol y dióxido de carbono como efecto secundario. Plataforma de creación de gráficos interactivos. Debido a la gran cantidad de datos recopilados de la producción y la propiedad de alta dimensión de las variables, observar los patrones de rendimiento y filtrar los factores influyentes que afectan el rendimiento son las dos partes más complejas durante el análisis de fermentación. Pero en JMP, todo el análisis se simplifica y la tubería de procesamiento es extremadamente sencilla: la plataforma de distribución de JMP y los histogramas interactivos se utilizan para investigar la estructura general de datos.

En cuanto a la selección de las variables estadísticamente significativas en el modelo de rendimiento, los factores influyentes se pueden resaltar y filtrar para crear un nuevo modelo con solo unos pocos clics.

Además, la visualización y el seguimiento de los patrones de rendimiento de etanol por tiempo y diferentes recipientes se revelan directamente utilizando la plataforma de creación de gráficos.

Además de la demostración de fermentación de etanol anterior, también encontramos una demostración de la aplicación JMP (la función utilizada: ajuste de curva no lineal) en evaluación biológica y un video de seminario web de JMP (plataformas utilizadas: partición y agrupación jerárquica) y la aplicación JMP Genomics (plataformas utilizado: mapas de ligamiento y QTL, análisis de reproducción) en la investigación sobre diversidad genómica y mejora vegetal.
Referencias
- Definición: Biotecnología Biotecnología Industrial | Departamento de Ingeniería Biológica y Ambiental (cornell.edu)
- Historia de cliente: Merck https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/merck.html
- Historia de cliente: Medtronic https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/medtronic.html
- Historia de cliente: Fujifilm Diosynth Biotechnologies https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/fujifilm-diosynth-biotechnologies.html
- Historia de ventas: Soluciones 25:2 https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/25-2-solutions.html
- Definición: DOE y QbD Diseño de Experimentos (DoE) | GreyRigge - La consultoría biotecnológica
- Demostración: Fermentación de etanol https://community.jmp.com/t5/Technical-Reference-Library/D47-Ferment-Hampton/ta-p/22217
- Demostración: Capacitación en bioensayo (evaluación biológica) https://community.jmp.com/t5/Technical-Reference-Library/T09-Bioassay-Training-Higgins/ta-p/23403
- Webinar: Diversidad Genómica y Fitomejoramiento https://community.jmp.com/t5/Mastering-JMP/Analyzing-Genetic-Diversity-and-Applying-Genomic-Selection/ta-p/285787?_ga=2.34849377.170966381.1642381957-1619470559.1635774407