Überblick
Die Cornell University gibt eine vereinfachte Definition des Hauptziels der Biotechnologiebranche: Enzyme, Mikroorganismen und Pflanzen zur Gewinnung von Energie, Chemikalien und Konsumgütern zu nutzen, zusammen mit technologischen Fortschritten in den Bereichen Genomik, Biokraftstoff, Datenanalyse und Automatisierung. Mit anderen Worten: Die Industrie erstellt Prozesse und manipuliert Produkte, um Entdeckungen mit dem Ziel einer Verbesserung der Produktqualität und der Ausbeute zu fördern.
Herausforderungen
Die schiere Datenmenge, die in der Bio-/Pharmaforschung anfällt, hat einen Bedarf an robusten Analysetools geschaffen, die gleichzeitig große Datenmengen verwalten können und gleichzeitig eine interaktive, benutzerfreundliche Schnittstelle bieten, die die Zusammenarbeit zwischen Experten mit unterschiedlichem statistischem Fachwissen erleichtert.Oftmals haben Benutzer Inhalte an mehreren Orten, was die gemeinsame Nutzung von Daten erschwert.JMP hilft ihnen, die Effizienz im gesamten Team zu verbessern, indem es Benutzern ermöglicht, ihre Erkenntnisse schnell zu teilen. Die JMP-Produktsuite aus Standard-JMP, Pro, Live, Clinical und Genomics fördert wirklich die Synergie innerhalb eines Unternehmens, um gemeinsam eine weitere Entdeckung in jedem Bereich zu erreichen.
Forscher müssen ihr Fachwissen durch Datenanalysen ergänzen, um schnellere und fundiertere Entscheidungen aus den vorhandenen Daten zu treffen und Probleme gleich beim ersten Mal richtig zu lösen.Sie benötigen eine effektive Analyse, um hohe Ausfälle oder kostenintensive Aspekte auszuschließen, um mehr Wert zu schaffen und Verschwendung zu reduzieren.In einer Branche, in der Designentscheidungen erhebliche Auswirkungen auf die Kosten haben, benötigen Wissenschaftler effizientere Ansätze zur Optimierung der biopharmazeutischen Prozessentwicklung.
Warum JMP?
Die JMP-Datenanalyse ermöglicht es einigen der weltweit größten und innovativsten Pharma- und Biotechunternehmen, Prozess- und Labordaten zu untersuchen, Quellen von Prozessabweichungen zu verstehen, mehr aus den Ursachenuntersuchungen zu lernen und Prozesse und Versuchsdesign zu optimieren – und das alles, ohne Code lernen zu müssen. Kurz gesagt, JMP spart Zeit und Geld und kann von allen Branchenmitarbeitern genutzt werden.
Wer nutzt JMP?
- Wissenschaftler
- Forschung und Entwicklung
- Biostatistiker
- Epidemiologe
Bewerbung von JMP S in der Biotech-Industrie
Unsere Teammitglieder führten ein Gespräch mit Tom Tao, der derzeit Systemingenieur im chinesischen HLS-Team (Health and Life Science) ist. Er teilte einige Informationen darüber mit, wie die Biotech-Industrie JMP und JMP Clinical in zwei unterschiedlichen Phasen der Arzneimittelentwicklung einsetzt:
Bühne 1 : Vor IND (Investigational New Drug Application)
- Hypothesentests: z. B. Testen der Wirksamkeit alter und neuer Medikamentenchargen
- DOE: ein integraler Bestandteil des Quality by Design (QbD)-Ansatzes, der bei der Entwicklung biologischer Produkte sowohl für Prozess- als auch für Analysemethoden angewendet wird
- Modellierung: Unterstützt die JMP DOE-Plattform bei der Bestimmung der optimalen Ergebnisse der biologischen Produktion
Stufe 2 : Nach IND – Kommerzialisierung und Massenproduktion
- a) SPC (Statistische Prozesskontrolle): Wird zur Stabilisierung und Kontrolle der Qualität der Arzneimittelproduktion verwendet
- b) Zuverlässigkeit: Stabilitäts- und Haltbarkeitsanalyse
Tom liefert auch ein Bild von Plattformen in JMP, die häufiger zur Unterstützung des gesamten Forschungs- und Produktionsprozesses der meisten Kunden aus der Biotech-Industrie eingesetzt werden. Diese Grafik wird auch häufig in den Vorverkaufsdemos des chinesischen HLS-Teams verwendet, insbesondere wenn das Publikum aus der Biotechnologie-, klinischen Forschungs- und Pharmaindustrie kommt, um zu zeigen, wie JMP die Idee von QbD (Quality by Design) unterstützt, die in der Biotech-Branche angewendet wird.
Branchenunternehmen, die JMP nutzen
Merck (Pharmaceutical) sah sich mit den rasanten Fortschritten in der Biomarker-Forschung durch den Einsatz statistischer Methoden zur Nutzung immer anspruchsvollerer onkologischer Daten konfrontiert. Ihre Biostatistiker nutzen interaktive Funktionen in JMP®, um robuste statistische Analysen in kürzerer Zeit durchzuführen. Die leicht zugängliche Schnittstelle von JMP erleichtert Statistikexperten die Zusammenarbeit mit Fachexperten.
https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/merck.html
Medtronic analysiert Daten, um Labortests zu erstellen und zu untersuchen, die dabei helfen, effiziente und genaue Geräte zu entwickeln. Das Forschungs- und Entwicklungsteam nutzt große Datensätze und statistische Analysen, um die Variablen zu bestimmen, die die Leistung eines Geräts am stärksten beeinflussen. Bei der LigaSure-Technologie handelt es sich beispielsweise um eine Reihe von Geräten, die chirurgische Eingriffe sicherer machen sollen. Mithilfe von JMP können die entwickelten Geräte die optimale Menge an Druck und Hochfrequenzenergie finden, um Blutgefäße während einer Operation wieder zu verbinden. Dies hat dazu geführt, dass der Blutverlust minimiert und die Genesungszeit der Patienten verkürzt wurde.
https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/medtronic.html
Fuji Film Diosynth Biotechnologies entwickelt und bietet Herstellungsverfahren von Wirkstoffen für Pharmaunternehmen an. Sie standen vor der Herausforderung, dass Wissenschaftler in einer Branche, in der Designentscheidungen erhebliche Auswirkungen auf die Kosten haben, effizientere Ansätze zur Optimierung der biopharmazeutischen Prozessentwicklung benötigen. Durch die Einführung von JMP Pro in das System trägt die maßgeschneiderte Versuchsplanung (DOE) dazu bei, Experimente zu optimieren und Entwicklungszeiten zu verkürzen. Darüber hinaus unterstützt der Functional Data Explorer (FDE) als Datentransformationstool Wissenschaftler bei der Vorbereitung von Daten für die Analyse – einschließlich DOE. JMP-Dashboards im HTML-Format dürfen auch mit Nicht-JMP-Benutzern geteilt werden.
https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/fujifilm-diosynth-biotechnologies.html
Verkaufsgeschichten gewinnen
25:2 Lösungen
25:2 Solutions ist auf den Einsatz von maschinellem Lernen spezialisiert, um Unternehmen bei der Entwicklung neuer und besserer Nutzpflanzen zu unterstützen. JMP Genomics wurde ursprünglich für einen Benutzer gekauft (12,6.000 US-Dollar) und hat seitdem ein Upgrade (zu weiteren 3.000 US-Dollar) durchgeführt und seitdem jede Lizenz erneuert.
„JMP Genomics hat uns geholfen, die Entwicklung von Zuchtlinien und -sorten zu beschleunigen“, sagt Genetiker und CTO von 25:2 Solutions Eric Jackson. Zeitersparnis ist jedoch nicht der einzige Vorteil. Jackson sagt, das Wichtigste sei die ständige Weiterentwicklung des Tools, da JMP-Softwareentwickler auf die Bedürfnisse der Benutzer hören, um neue Funktionen zu entwerfen und zu entwickeln.
https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/25-2-solutions.html
Pfizer
Pfizer, das zweitgrößte Pharmaunternehmen der Welt, unterzeichnete am Donnerstag einen Vertrag über 30 Lizenzen von JMP Clinical im Wert von fast 100.000 US-Dollar. Pfizer wird die Software für die Überprüfung klinischer Daten und die Erstellung von Patientenberichten verwenden, während es eine neue Klasse von cholesterinsenkenden Medikamenten testet, die auf ein Enzym namens PCSK9 abzielen. „Unter den Pharmaunternehmen gibt es einen großen Wettlauf darum, wer als Erster damit auf den Markt kommt“, erklärte David Schultz. „Es ist eines der Projekte mit der höchsten Priorität bei Pfizer, das sich derzeit in der klinischen Phase befindet.“
Ende letzten Jahres hielt das JMP-Team eine erste Präsentation vor der Pfizer-Gruppe, die für die Überprüfung und Analyse klinischer Daten verantwortlich ist. Mitte 2014 begann eine Software-Evaluierung. Ende August demonstrierte der JMP-Champion von Pfizer JMP Clinical den Klinikern, die die Software verwenden würden. David erinnerte sich, dass während der Präsentation „der klinische Leiter das Telefon stummschaltete und zum Champion sagte: ‚Wann können wir diese Software bekommen?‘ Es ist genau das, was wir brauchen.‘“ Es folgte ein langwieriger Beschaffungsprozess, bei dem Budgetkürzungen den Kauf zeitweise unwahrscheinlich erscheinen ließen.
Schließlich sei der leitende Direktor für Datenanalyse und Berichterstattung „vorgegangen und habe herausgefunden, wie man das umsetzen kann“, sagte David. Sowohl er als auch Doug Robinson schrieben Kelci Miclaus zu, dass er zum Erfolg des Deals beigetragen habe. „Kelci hat viel Zeit darauf verwendet, mit Pfizer zusammenzuarbeiten und ihnen bei der Bewertung zu helfen“, sagte David. „Es wurde viel Arbeit investiert, um zu beweisen, dass JMP Clinical in der Lage sein würde, die Daten aus der PCSK9-Studie zu lesen.“ Vorausgesetzt, dass dieses Pilotprojekt erfolgreich ist, wird Pfizer „ein ganz besonderer Account für JMP sein“, sagte David. „Dass Pfizer JMP Clinical nutzt, ist sehr, sehr bedeutsam. Für das nächste Jahr gibt es ein wunderbares Wachstumspotenzial.“
- Produkt: JMP Clinical
- Betrag: 98.971 $
- Integrale Akteure: Dan Durkin, Mary Loveless, Geoff Mann, Kelci Miclaus, Doug Robinson, David Schultz, Jon Weisz
Re Levante De mo Ressourcen
JMP, JMP Pro, JMP Clinical und JMP Genomics werden häufig zur Unterstützung des Datenexplorations- und Modellierungsprozesses in der biologischen Produktion eingesetzt. Unser Team hat die technische Referenzbibliothek durchsucht und festgestellt, dass zwei Demos und ein Webinar verfügbar sind.
Als Beispiel haben wir eine von zwei Demos genommen: die Ethanolfermentation und den Datensatz „Ferm at Age 32 hrs“. Die Ethanolgärung (auch als alkoholische Gärung bekannt) ist ein biologischer Prozess, der Zucker (Glukose, Fruktose, Saccharose) in Zellenergie umwandelt und dabei als Nebenwirkung Ethanol und Kohlendioxid erzeugt. Interaktive Diagrammerstellungsplattform. Aufgrund der großen Datenmengen, die bei der Produktion gesammelt werden, und der hochdimensionalen Eigenschaften von Variablen sind die Untersuchung der Ertragsmuster und das Herausfiltern von Einflussfaktoren, die sich auf den Ertrag auswirken, die beiden komplexesten Teile der Fermentationsanalyse. Aber in JMP ist die gesamte Analyse vereinfacht und die Verarbeitungspipeline äußerst unkompliziert: Die Verteilungsplattform und interaktive Histogramme von JMP werden zur Untersuchung der allgemeinen Datenstruktur verwendet.
Bei der Auswahl der statistisch signifikanten Variablen im Ertragsmodell können Einflussfaktoren hervorgehoben und herausgefiltert werden, um mit nur wenigen Klicks ein neues Modell zu erstellen.
Darüber hinaus können mithilfe der Graph Builder-Plattform die Muster der Ethanolausbeute nach Zeit und in verschiedenen Gefäßen direkt visualisiert und verfolgt werden.
Zusätzlich zur obigen Demo zur Ethanolfermentation haben wir auch eine Demo der JMP-Anwendung (die verwendete Funktion: Anpassen der nichtlinearen Kurve) in der biologischen Bewertung und ein Webinar-Video von JMP (verwendete Plattformen: Partitionierung und hierarchisches Clustering) und der JMP Genomics-Anwendung (Plattformen) gefunden verwendet: Verknüpfungskarten und QTL, Zuchtanalyse) bei der Erforschung der Genomdiversität und Pflanzenzüchtung.
Verweise
- Definition: Biotechnologie Industrielle Biotechnologie | Abteilung für Bio- und Umweltingenieurwesen (cornell.edu)
- Kundengeschichte: Merck https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/merck.html
- Kundengeschichte: Medtronic https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/medtronic.html
- Kundengeschichte: Fujifilm Diosynth Biotechnologies https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/fujifilm-diosynth-biotechnologies.html
- Verkaufsgeschichte: 25:2-Lösungen https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/25-2-solutions.html
- Definition: DOE und QbD Versuchsplanung (DoE) | GreyRigge – Das Biotech-Beratungsunternehmen
- Demo: Ethanolfermentation https://community.jmp.com/t5/Technical-Reference-Library/D47-Ferment-Hampton/ta-p/22217
- Demo: Schulung zum Bioassay (biologische Beurteilung). https://community.jmp.com/t5/Technical-Reference-Library/T09-Bioassay-Training-Higgins/ta-p/23403
- Webinar: Genomische Vielfalt und Pflanzenzüchtung https://community.jmp.com/t5/Mastering-JMP/Analyzing-Genetic-Diversity-and-Applying-Genomic-Selection/ta-p/285787?_ga=2.34849377.170966381.1642381957-1619470559.1635774407
