Aperçu
L'Université Cornell donne une définition simplifiée de l'objectif principal de l'industrie de la biotechnologie : utiliser des enzymes, des micro-organismes et des plantes pour produire de l'énergie, des produits chimiques et des biens de consommation, ainsi que des avancées technologiques en matière de génomique, de biocarburant, d'analyse de données et d'automatisation. En d’autres termes, l’industrie crée des processus et manipule les produits pour promouvoir la découverte dans le but d’améliorer la qualité des produits et le rendement.
Défis
La grande quantité de données impliquées dans la recherche bio/pharmaceutique a créé un besoin pour des outils analytiques robustes capables de gérer simultanément une grande quantité de données tout en fournissant une interface interactive et conviviale qui facilite la collaboration entre des experts possédant une gamme d'expertise statistique.Souvent, les utilisateurs ont du contenu à plusieurs endroits, ce qui rend difficile le partage de données.JMP les aide à améliorer l'efficacité des équipes en permettant aux utilisateurs de partager rapidement leurs découvertes. La suite JMP de produits standards JMP, Pro, Live, Clinical et Genomics favorise véritablement la synergie au sein d'une entreprise pour collaborer à de nouvelles découvertes dans chaque domaine.
Les chercheurs doivent compléter leurs connaissances en la matière par des analyses de données pour prendre des décisions plus rapides et mieux informées à partir des données existantes et résoudre les problèmes correctement du premier coup.Ils ont besoin d'une analyse efficace pour éliminer les échecs importants ou les aspects coûteux afin de capturer plus de valeur et de réduire le gaspillage.Dans une industrie où les décisions de conception ont un impact significatif sur les coûts, les scientifiques ont besoin d’approches plus efficaces pour optimiser le développement des processus biopharmaceutiques.
Pourquoi JMP ?
L'analyse des données JMP permet à certaines des sociétés pharmaceutiques et biotechnologiques les plus importantes et les plus innovantes au monde d'explorer les données de processus et de laboratoire, de comprendre les sources des variations de processus, d'en apprendre davantage sur les recherches sur les causes profondes et d'optimiser les processus et la conception expérimentale, le tout sans avoir à apprendre le code. En bref, JMP permet d'économiser du temps et de l'argent et peut être utilisé par n'importe quel niveau d'employé de l'industrie.
Qui utilise JMP ?
- Scientifique
- R&D
- Biostatisticiens
- Épidémiologiste
L'application JMP s dans l'industrie biotechnologique
Les membres de notre équipe ont eu une conversation avec Tom Tao, qui est actuellement l'ingénieur système de l'équipe chinoise HLS (Santé et sciences de la vie). Il a partagé quelques informations sur la manière dont l'industrie biotechnologique applique JMP et JMP Clinical au cours de deux étapes distinctes du développement de médicaments :
Étape 1 : Avant l'IND (Investigational New Drug Application)
- Test d'hypothèse : comme tester l'efficacité d'anciens et de nouveaux lots de médicaments
- DOE : partie intégrante de la démarche Quality by Design (QbD), appliquée au développement de produits biologiques tant pour les procédés que pour les méthodes analytiques
- Modélisation : aide la plateforme JMP DOE à déterminer les résultats optimaux de la production biologique
Étape 2 : Après IND – Commercialisation et Production de Masse
- a) SPC (Statistical Process Control) : utilisé pour stabiliser et contrôler la qualité de la production de médicaments
- b) Fiabilité : analyse de stabilité et de durée de conservation
Tom fournit également une image des plates-formes de JMP qui sont plus fréquemment utilisées pour assister l'ensemble du processus de recherche et de production de la plupart des clients du secteur biotechnologique. Ce graphique est également fréquemment utilisé dans les démonstrations de prévente de l'équipe China HLS, en particulier lorsque le public est issu des secteurs de la biotechnologie, de la recherche clinique et de l'industrie pharmaceutique, pour montrer comment JMP soutient l'idée de QbD (Quality by Design) appliquée dans l'industrie biotechnologique.

Entreprises qui utilisent JMP
Merck (Pharmaceutique) a été confrontée aux progrès rapides de la recherche sur les biomarqueurs en déployant des méthodes statistiques pour exploiter des données oncologiques de plus en plus sophistiquées. Leurs biostatisticiens utilisent les fonctionnalités interactives de JMP® pour effectuer des analyses statistiques robustes en moins de temps. L'interface conviviale de JMP permet aux experts en statistiques de collaborer facilement avec des experts en la matière.
https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/merck.html
Medtronic analyse les données pour créer et étudier des tests de laboratoire qui aident à créer des appareils efficaces et précis. Son équipe de recherche et développement utilise de grands ensembles de données et des analyses statistiques pour déterminer les variables qui affectent le plus les performances d'un appareil. Par exemple, la technologie LigaSure est une série de dispositifs visant à rendre la chirurgie plus sûre. Grâce à JMP, les appareils développés peuvent trouver la quantité optimale de pression et d’énergie radiofréquence pour reconnecter les vaisseaux sanguins pendant l’intervention chirurgicale. Cela a permis de minimiser la perte de sang et de réduire les temps de récupération des patients.
https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/medtronic.html
Fuji film Diosynthe Biotechnologies développe et propose des procédés de fabrication de principes actifs pour les laboratoires pharmaceutiques. Ils étaient confrontés au défi suivant : dans une industrie où les décisions de conception ont un impact significatif sur les coûts, les scientifiques ont besoin d'approches plus efficaces pour optimiser le développement des processus biopharmaceutiques. En introduisant JMP Pro dans le système, la conception d'expériences sur mesure (DOE) permet d'optimiser l'expérimentation et de réduire les temps de développement. En outre, Functional Data Explorer (FDE), en tant qu'outil de transformation de données, aide les scientifiques à préparer les données pour l'analyse, y compris le DOE. Les tableaux de bord JMP au format HTML peuvent également être partagés avec des utilisateurs non-JMP.
https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/fujifilm-diosynth-biotechnologies.html
Les histoires de vente gagnent
Solutions 25:2
25:2 Solutions se spécialise dans l'utilisation de l'apprentissage automatique pour aider les entreprises à développer de nouvelles et meilleures cultures. JMP Genomics a été initialement acheté pour un utilisateur (12,6 000 $) et a depuis été mis à niveau (en ajoutant 3 000 $ supplémentaires) et renouvelé chaque licence depuis.
« JMP Genomics nous a aidé à accélérer le développement de lignées et de variétés de sélection », déclare Eric Jackson, généticien et directeur technique de 25:2 Solutions. Mais le gain de temps n’est pas le seul avantage. Selon Jackson, le plus important est l'évolution constante de l'outil, les développeurs de logiciels JMP étant à l'écoute des besoins des utilisateurs pour concevoir et développer de nouvelles fonctionnalités.
https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/25-2-solutions.html
Pfizer
Pfizer, la deuxième société pharmaceutique mondiale, a signé jeudi un contrat portant sur 30 licences de JMP Clinical, pour une valeur de près de 100 000 dollars. Pfizer utilisera le logiciel pour examiner les données cliniques et créer des récits de patients dans le cadre du test d'une nouvelle classe de médicaments hypocholestérolémiants ciblant une enzyme connue sous le nom de PCSK9. « Il y a une grande course entre les sociétés pharmaceutiques pour savoir qui sera la première à le commercialiser », a expliqué David Schultz. "C'est actuellement l'un des projets les plus prioritaires de Pfizer au stade clinique."
À la fin de l'année dernière, l'équipe JMP a fait une première présentation au groupe Pfizer responsable de l'examen et de l'analyse des données cliniques. Une évaluation du logiciel a débuté mi-2014. Fin août, le champion JMP de Pfizer faisait une démonstration de JMP Clinical aux cliniciens qui allaient utiliser le logiciel. David a rappelé que lors de la présentation, « le responsable clinique a mis le téléphone en sourdine et a dit au champion : « Quand pourrons-nous obtenir ce logiciel ? C'est exactement ce dont nous avons besoin. » Un processus d'approvisionnement tortueux s'en est suivi, avec des coupes budgétaires rendant l'achat parfois improbable.
Finalement, le directeur principal de l’analyse des données et du reporting « s’est mobilisé et a compris comment y parvenir », a déclaré David. Lui et Doug Robinson ont tous deux crédité Kelci Miclaus d'avoir contribué au succès de l'accord. « Kelci a consacré une grande partie de son temps à travailler avec Pfizer et à les aider tout au long de l'évaluation », a déclaré David. « De nombreux travaux ont été déployés pour prouver que JMP Clinical serait capable de lire les données de l'étude PCSK9. » En supposant que ce projet pilote réussisse, Pfizer « constituera un compte très spécial pour JMP », a déclaré David. « Que Pfizer utilise JMP Clinical est très, très significatif. L’année prochaine, il y a un merveilleux potentiel de croissance.
- Produit : JMP Clinique
- Montant : 98 971 $
- Joueurs intégraux : Dan Durkin, Mary Loveless, Geoff Mann, Kelci Miclaus, Doug Robinson, David Schultz, Jon Weisz
Concernant Levant De mo Ressources
JMP, JMP Pro, JMP Clinical et JMP Genomics sont largement utilisés pour faciliter le processus d'exploration et de modélisation des données dans la production biologique. Notre équipe a effectué des recherches dans la bibliothèque de référence technique et a découvert que deux démos et un webinaire étaient disponibles.
Nous avons pris comme exemple l'une des deux démos : la fermentation de l'éthanol et l'ensemble de données « Ferm at Age 32 hrs ». La fermentation éthanolique (également connue sous le nom de fermentation alcoolique) est un processus biologique qui convertit les sucres (glucose, fructose, saccharose) en énergie cellulaire, produisant de l'éthanol et du dioxyde de carbone comme effet secondaire. Plate-forme de création de graphiques interactifs. En raison de la grande quantité de données collectées sur la production et des propriétés de grande dimension des variables, l'examen des modèles de rendement et le filtrage des facteurs influents qui affectent le rendement sont les deux parties les plus complexes de l'analyse de la fermentation. Mais dans JMP, l'ensemble de l'analyse est simplifiée et le pipeline de traitement est extrêmement simple : la plate-forme de distribution de JMP et les histogrammes interactifs sont utilisés pour étudier la structure générale des données.

Quant à la sélection des variables statistiquement significatives dans le modèle de rendement, les facteurs influents peuvent être mis en évidence et filtrés pour construire un nouveau modèle en quelques clics seulement.

En outre, la visualisation et le suivi des modèles de rendements d'éthanol en fonction du temps et des différents récipients sont directement révélés à l'aide de la plateforme de création de graphiques.

En plus de la démonstration de fermentation à l'éthanol ci-dessus, nous avons également trouvé une démo de l'application JMP (la fonction utilisée : ajustement de courbe non linéaire) dans l'évaluation biologique et une vidéo de webinaire de JMP (plateformes utilisées : partition et clustering hiérarchique) et de l'application JMP Genomics (plateformes utilisés : cartes de liaison et QTL, analyse de sélection) dans la recherche sur la diversité génomique et la sélection végétale.
Les références
- Définition : Biotechnologie Biotechnologie industrielle | Département de génie biologique et environnemental (cornell.edu)
- Témoignage client : Merck https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/merck.html
- Témoignage client : Medtronic https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/medtronic.html
- Témoignage client : Fujifilm Diosynth Biotechnologies https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/fujifilm-diosynth-biotechnologies.html
- Histoire de vente : Solutions 25:2 https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/25-2-solutions.html
- Définition : DOE et QbD Plans d'expériences (DoE) | GreyRigge - Le conseil en biotechnologie
- Démo : Fermentation à l'éthanol https://community.jmp.com/t5/Technical-Reference-Library/D47-Ferment-Hampton/ta-p/22217
- Démo : Formation sur les essais biologiques (évaluation biologique) https://community.jmp.com/t5/Technical-Reference-Library/T09-Bioassay-Training-Higgins/ta-p/23403
- Webinaire : Diversité génomique et sélection végétale https://community.jmp.com/t5/Mastering-JMP/Analyzing-Genetic-Diversity-and-Applying-Genomic-Selection/ta-p/285787?_ga=2.34849377.170966381.1642381957-1619470559.1635774407