Aperçu
L'Université Cornell donne une définition simplifiée de l'objectif principal de l'industrie de la biotechnologie : utiliser des enzymes, des micro-organismes et des plantes pour produire de l'énergie, des produits chimiques et des biens de consommation, ainsi que des avancées technologiques dans la génomique, les biocarburants, l'analyse de données et l'automatisation. En d'autres termes, l'industrie crée des processus et manipule des produits pour promouvoir la découverte dans le but d'améliorer la qualité des produits et le rendement.
Défis
La grande quantité de données impliquées dans la recherche Bio/Pharma a créé un besoin d'outils analytiques robustes capables de gérer simultanément une grande quantité de données tout en fournissant une interface interactive et conviviale qui facilite la collaboration entre des experts ayant une gamme d'expertise statistique.Souvent, les utilisateurs ont du contenu à plusieurs endroits, ce qui rend difficile le partage de données.JMP les aide à améliorer l'efficacité de leurs équipes en permettant aux utilisateurs de partager rapidement leurs découvertes. La suite JMP de produits standard JMP, Pro, Live, Clinical et Genomics favorise véritablement la synergie au sein d'une entreprise pour collaborer à une découverte supplémentaire dans chaque domaine.
Les chercheurs doivent compléter leurs connaissances sur le sujet avec des analyses de données pour prendre des décisions plus rapides et mieux informées à partir des données existantes et pour résoudre correctement les problèmes du premier coup.Ils ont besoin d'une analyse efficace pour éliminer les défaillances importantes ou les aspects coûteux afin de capturer plus de valeur et de réduire le gaspillage.Dans une industrie où les décisions de conception ont un impact significatif sur les coûts, les scientifiques ont besoin d'approches plus efficaces pour optimiser le développement de processus biopharmaceutiques.
Pourquoi JMP ?
L'analyse de données JMP permet à certaines des sociétés pharmaceutiques et biotechnologiques les plus importantes et les plus innovantes au monde d'explorer les données de processus et de laboratoire, de comprendre les sources des variations de processus, d'en savoir plus sur les recherches sur les causes profondes et d'optimiser les processus et la conception expérimentale, le tout sans apprendre de code. En bref, JMP permet d'économiser du temps et de l'argent et peut être utilisé par n'importe quel niveau d'employé de l'industrie.
Qui utilise JMP ?
- Scientifique
- R&D
- Biostatisticiens
- Épidémiologiste
Demande de JMP s dans l'industrie biotechnologique
Les membres de notre équipe ont eu une conversation avec Tom Tao, qui est actuellement l'ingénieur système de l'équipe chinoise HLS (Health and Life Science). Il a partagé des informations sur la manière dont l'industrie biotechnologique applique JMP et JMP Clinical à deux étapes distinctes du développement de médicaments :
Étape 1 : Avant IND (Investigational New Drug Application)
- Test d'hypothèse : tel que tester l'efficacité d'anciens et de nouveaux lots de médicaments
- DOE : partie intégrante de la démarche Quality by Design (QbD), appliquée au développement de produits biologiques tant pour les procédés que pour les méthodes analytiques
- Modélisation : aide la plate-forme JMP DOE à déterminer les résultats optimaux de la production biologique
Étape 2 : Après IND – Commercialisation et production de masse
- a) SPC (Statistical Process Control) : utilisé pour stabiliser et contrôler la qualité de la production de médicaments
- b) Fiabilité : analyse de la stabilité et de la durée de conservation
Tom fournit également une image des plates-formes dans JMP qui sont plus fréquemment utilisées pour assister l'ensemble du processus de recherche et de production de la plupart des clients de l'industrie biotechnologique. Ce graphique est également fréquemment utilisé dans les démonstrations de prévente de l'équipe China HLS, en particulier lorsque le public est issu de l'industrie de la biotechnologie, de la recherche clinique et pharmaceutique pour montrer comment JMP soutient l'idée de QbD (Quality by Design) appliquée dans l'industrie de la biotechnologie.

Entreprises du secteur qui utilisent JMP
Merck (pharmaceutique) a été mis au défi par les progrès rapides de la recherche sur les biomarqueurs en déployant des méthodes statistiques pour exploiter des données oncologiques de plus en plus sophistiquées. Leurs biostatisticiens utilisent les fonctionnalités interactives de JMP® pour effectuer des analyses statistiques robustes en moins de temps. L'interface conviviale de JMP permet aux experts statistiques de collaborer facilement avec des experts en la matière.
https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/merck.html
Medtronic analyse les données pour créer et étudier des tests de laboratoire qui aident à créer des appareils efficaces et précis. Son équipe de recherche et développement utilise de grands ensembles de données et des analyses statistiques pour déterminer les variables qui affectent le plus les performances d'un appareil. Par exemple, la technologie LigaSure est une série de dispositifs visant à rendre la chirurgie plus sûre. Grâce à JMP, les dispositifs développés peuvent trouver la quantité optimale de pression et d'énergie radiofréquence pour reconnecter les vaisseaux sanguins pendant la chirurgie. Cela a permis de minimiser les pertes de sang et de réduire les temps de récupération des patients.
https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/medtronic.html
Fuji film Diosynth Biotechnologies développe et propose des procédés de fabrication de principes actifs pour les laboratoires pharmaceutiques. Ils étaient confrontés au défi que, dans une industrie où les décisions de conception ont un impact significatif sur les coûts, les scientifiques ont besoin d'approches plus efficaces pour optimiser le développement de processus biopharmaceutiques. En introduisant JMP Pro dans le système, la conception d'expériences sur mesure (DOE) permet d'optimiser l'expérimentation et de raccourcir les temps de développement. En outre, Functional Data Explorer (FDE), en tant qu'outil de transformation de données, aide les scientifiques à préparer les données pour l'analyse, y compris le DOE. Les tableaux de bord JMP au format HTML peuvent également être partagés avec des utilisateurs non JMP.
https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/fujifilm-diosynth-biotechnologies.html
Les histoires de vente gagnent
Solution 25:2
25:2 Solutions se spécialise dans l'utilisation de l'apprentissage automatique pour aider les entreprises à développer de nouvelles et meilleures cultures. A l'origine acheté JMP Genomics pour un utilisateur (12,6 000 $) et a depuis mis à niveau (en ajoutant 3 000 $ supplémentaires) et renouvelé chaque licence depuis.
« JMP Genomics nous a aidés à accélérer le développement de lignées et de variétés génétiques », déclare Eric Jackson, généticien et CTO de 25:2 Solutions. Le gain de temps n'est cependant pas le seul avantage. Jackson dit que la chose la plus importante est l'évolution constante de l'outil car les développeurs de logiciels JMP écoutent les besoins des utilisateurs pour concevoir et développer de nouvelles fonctionnalités.
https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/25-2-solutions.html
Pfizer
Pfizer, la deuxième plus grande société pharmaceutique au monde, a signé jeudi un contrat pour 30 licences de JMP Clinical dans le cadre d'un accord évalué à près de 100 000 dollars. Pfizer utilisera le logiciel pour l'examen des données cliniques et la création de récits de patients alors qu'il teste une nouvelle classe de médicaments hypocholestérolémiants ciblant une enzyme connue sous le nom de PCSK9. "Il y a une grande course parmi les sociétés pharmaceutiques pour voir qui sera le premier à le commercialiser", a expliqué David Schultz. "C'est l'un des projets les plus prioritaires de Pfizer en ce moment au stade clinique."
À la fin de l'année dernière, l'équipe de JMP a fait une première présentation au groupe Pfizer responsable de l'examen et de l'analyse des données cliniques. Une évaluation du logiciel a débuté mi-2014. Fin août, le champion de JMP chez Pfizer faisait une démonstration de JMP Clinical aux cliniciens qui utiliseraient le logiciel. David a rappelé que lors de la présentation, "le responsable clinique a mis le téléphone en mode silencieux et a dit au champion : 'Quand pouvons-nous obtenir ce logiciel ? C'est exactement ce dont nous avons besoin. » Un processus d'approvisionnement tortueux a suivi, avec des coupes budgétaires rendant l'achat parfois improbable.
Finalement, le directeur principal de l'analyse des données et des rapports "a intensifié et compris comment y arriver", a déclaré David. Lui et Doug Robinson ont tous deux crédité Kelci Miclaus d'avoir contribué à assurer le succès de l'accord. "Kelci a consacré une grande partie de son temps à travailler avec Pfizer et à les aider tout au long de l'évaluation", a déclaré David. « Beaucoup de travail a été fait pour prouver que JMP Clinical serait capable de lire les données de l'étude PCSK9. En supposant que ce projet pilote réussisse, Pfizer "sera un compte très spécial pour JMP", a déclaré David. « Le fait que Pfizer utilise JMP Clinical est très, très significatif. À l'approche de l'année prochaine, il y a un formidable potentiel de croissance.
- Produit : JMP Clinique
- Montant : 98 971 $
- Joueurs intégraux : Dan Durkin, Mary Loveless, Geoff Mann, Kelci Miclaus, Doug Robinson, David Schultz, Jon Weisz
Ré Levant De Mo Ressources
JMP, JMP Pro, JMP Clinical et JMP Genomics sont largement utilisés pour assister le processus d'exploration et de modélisation des données dans la production biologique. Notre équipe a fait des recherches dans la bibliothèque de référence technique, a trouvé deux démos et un webinaire disponibles.
Nous avons pris l'une des deux démos : la fermentation à l'éthanol et l'ensemble de données « Ferm at Age 32 hrs », comme exemple. La fermentation éthanolique (également connue sous le nom de fermentation alcoolique) est un processus biologique qui convertit les sucres (glucose, fructose, saccharose) en énergie cellulaire, produisant de l'éthanol et du dioxyde de carbone comme effet secondaire Plateforme de création de graphiques interactifs. En raison de la grande quantité de données collectées à partir de la production et des propriétés de grande dimension des variables, l'examen des modèles de rendement et le filtrage des facteurs influents qui affectent le rendement sont les deux parties les plus complexes de l'analyse de la fermentation. Mais dans JMP, l'ensemble de l'analyse est simplifié et le pipeline de traitement est extrêmement simple : la plate-forme de distribution et les histogrammes interactifs de JMP sont utilisés pour étudier la structure générale des données.

Quant à la sélection des variables statistiquement significatives dans le modèle de rendement, les facteurs influents peuvent être mis en évidence et filtrés pour construire un nouveau modèle en quelques clics.

En outre, la visualisation et le suivi des modèles de rendements d'éthanol en fonction du temps et des différents navires sont directement révélés à l'aide de la plate-forme de création de graphiques.

En plus de la démo de fermentation éthanolique ci-dessus, nous avons également trouvé une démo de l'application JMP (la fonction utilisée : ajustement de la courbe non linéaire) en évaluation biologique et une vidéo webinaire de JMP (plateformes utilisées : partition et clustering hiérarchique) et de l'application JMP Genomics (plateformes utilisées : cartes de liaison et QTL, analyse de sélection) dans la recherche sur la diversité génomique et la sélection végétale.
Les références
- Définition : Biotechnologie Biotechnologie industrielle | Département de génie biologique et environnemental (cornell.edu)
- Témoignage client : Merck https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/merck.html
- Témoignage client : Medtronic https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/medtronic.html
- Témoignage client : Fujifilm Diosynth Biotechnologies https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/fujifilm-diosynth-biotechnologies.html
- Histoire de vente : Solutions 25:2 https://www.jmp.com/en_us/customer-stories/25-2-solutions.html
- Définition : DOE et QbD Conception d'expériences (DoE) | GreyRigge - Le cabinet de conseil en biotechnologie
- Démo : Fermentation à l'éthanol https://community.jmp.com/t5/Technical-Reference-Library/D47-Ferment-Hampton/ta-p/22217
- Démo : formation sur les essais biologiques (évaluation biologique) https://community.jmp.com/t5/Technical-Reference-Library/T09-Bioassay-Training-Higgins/ta-p/23403
- Webinaire : Diversité génomique et sélection végétale https://community.jmp.com/t5/Mastering-JMP/Analyzing-Genetic-Diversity-and-Applying-Genomic-Selection/ta-p/285787?_ga=2.34849377.170966381.1642381957-1619470559.1635774407