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Come eseguire l'adattamento di Y rispetto a X se voglio farlo per X fattoriali

Ciao,

Sto cercando di analizzare la sopravvivenza cellulare in risposta a più farmaci per comprendere gli effetti sinergici

Per esempio:

X1	X2	X3	Y
100	100	10	5
50	50	5	25
200	200	0	10
100	100	0	30
200	0	10	3
100	0	5	20
0	200	10	1
0	100	5	8
0	0	0	60

Esiste un modo per eseguire Fit Y con tre diversi farmaci X1, X2 e X3 su JMP?

Inizialmente ho eseguito Fit Model e ho creato profiler di previsione, ma i valori di previsione sono molto lontani dai valori osservati.

I ho applicato Logit/LogitPct/e tutte le altre trasformazioni alla risposta Y nella finestra di dialogo di avvio Stima modello ma i valori di previsione non sono vicini ai valori osservati.

C'è un modo per analizzare Y come risposta a X fattoriali?

Esplorazione e visualizzazione dei datiRe: Come fare Fit Y per X se voglio fare per Xs fattoriali

Un'altra idea è quella di utilizzare un'analisi probit con JMP. Misuri la sopravvivenza cellulare, quindi se conosci il numero di celle all'inizio e il numero ancora vivo alla fine, puoi utilizzare il predittore lineare con questi conteggi.

 

Non ho un esempio come i tuoi dati, ma posso illustrare con la tabella dei dati Ingots2 nella cartella JMP Sample Data. Ecco la tabella dei dati:

 

 

Abbiamo il conteggio dei lingotti pronti, non pronti e il totale. Questo è analogo alle tue cellule che sono vive, morte e totali. Quindi apriamo la finestra di dialogo Adatta modello e apportiamo queste modifiche:

 

 

Il modello iniziale include entrambi i fattori e la loro interazione. I tuoi fattori sarebbero invece i farmaci. I risultati per questo modello mostrano che l'interazione qui non è significativa.

 

 

I termini non significativi vengono rimossi e il modello ridotto (in questo caso) ha un solo fattore.

 

 

Possiamo vedere che all'aumentare del livello del fattore, aumenta anche la proporzione dei non pronti. Puoi anche usare un profiler con questo modello.

Re: Come fare Fit Y per X se voglio fare per Xs fattoriali

Non sono sicuro del motivo per cui non puoi utilizzare Fit Least Squares. Ho anche catturato il tuo esempio come @statman e analizzato i tuoi dati in questo modo. Ottengo un modello ragionevole. Il fattore X1 sembra non avere alcun effetto. L'X2 e l'X3 hanno entrambi effetti e un'interazione, che è quello che volevi sapere. Ecco la trama effettiva per previsione, che mostra un accordo ragionevolmente buono tra le osservazioni che hai pubblicato e il modello ridotto che ho usato.

 

Re: Come fare Fit Y per X se voglio fare per Xs fattoriali

Ciao @joepark ,

 

Usando la tua tabella di dati di esempio, puoi eseguire tutti i tipi di adattamento Y per modelli. Puoi eseguirli individualmente utilizzando la piattaforma Adatta Y per X e quindi eseguire un adattamento lineare (o non lineare) a ciascuno degli Y per X1, Y per X2 e Y per X3. Puoi passare avanti e indietro molto facilmente utilizzando il selettore di colonna. Vai al pulsante di scelta rapida rosso accanto all'adattamento bivariato> Ripeti> Commutatore di colonna. Quindi seleziona X1 nel pannello superiore e tutte le altre X nel pannello inferiore, quindi premi OK. Questo dovrebbe rispondere alla tua prima domanda, ma non risponderà ad alcun effetto sinergico.

 

Non sono sicuro di seguire davvero la tua domanda su come analizzare Y come risposta a X fattoriali. Il tuo DOE era originariamente basato su un disegno fattoriale? Se si sta tentando di eseguire un modello di adattamento e gli effetti del modello devono essere definiti da un fattoriale completo, dopo aver avviato la piattaforma e aver selezionato da X1 a X3, fare clic sull'opzione Macro e selezionare fattoriale completo. Quindi puoi ridurre gli effetti del modello per ottenere un adattamento ragionevole. Prendi nota degli effetti che hanno accanto il carato "^". Ciò significa che verrebbero visualizzati termini di ordine elevato (quelli contenenti cose come X1*X1 o X1*X2 prima l'effetto dell'ordine principale come X1. Usando la tua tabella di dati, suggerisce che X1 non è un fattore significativo e vuole rimuoverlo dall'adattamento. Dovresti valutare se questo ha senso o meno.

 

Potrebbe essere necessario espandere il DOE o eseguire repliche per ridurre il rumore nel sistema. Il profiler di previsione è utile, ma ciò che è più importante è se il modello di adattamento e i dati si trovano sempre all'interno dell'intervallo di confidenza +/-95%. Puoi accedervi dal pulsante di scelta rapida rosso e salvarli come colonne. Nel caso di test che ho fatto, tutti i dati (Y e valori di previsione) rientrano in questi CI. Potrebbe essere necessario ripensare il modello per assicurarsi che sia sufficientemente preciso.

 

Spero questo sia di aiuto,

DS

Re: Come fare Fit Y per X se voglio fare per Xs fattoriali

Ciao statista,

Grazie per la risposta. Sfortunatamente, non sono autorizzato a condividere dati senza autorizzazione.

Mi scuso per la mancanza di integratori.

 

Sto analizzando gli effetti sinergici di più farmaci.

Il mio primo approccio è stato il modello Fit, quindi ho avuto i profiler di previsione. Poi ho scoperto che i valori di previsione sono molto lontani dai valori sperimentali.

Ieri ho posto domande su questo e ho ricevuto ottimi feedback (trasformando le risposte alla finestra di dialogo del modello Logit in Fit)

Dopo aver trasformato le risposte, i profiler di previsione sono più vicini ai valori sperimentali ma non è abbastanza vicino.

Ecco il mio post originale per il riferimento ( https://community.jmp.com/t5/Discussions/Prediction-profiler-prediction-values-do-not-match-with-the/mp/449473#M69631 )

 

Mi chiedo se posso fare Fit Y di X. Nel mio caso, ho 3 fattori (Xs) e una risposta (Y). Ogni X ha un diverso intervallo di concentrazione.

Quindi come il fattoriale completo voglio fare

Adatta Y per X1*X2

X1*X3

X2*X3

X1*X2*X3

È possibile farlo su JMP?

 

Re: Come fare Fit Y per X se voglio fare per Xs fattoriali

Joe,

È utile aggiungere solo il file JMP.

Ho creato la tabella dei dati in JMP e ho creato un modello di adattamento (iniziato con un modello saturo e poi ridotto). Ho salvato la formula di previsione nella tabella dei dati (in allegato)

 

Non ho idea su cosa stai sperimentando, se i tuoi dati hanno un valore pratico o se i risultati hanno un senso scientifico così difficile da fornire consigli.