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Comment faire Ajuster Y par X si je veux faire pour les X factoriels

Bonjour,

J'essaie d'analyser la survie cellulaire en réponse à plusieurs médicaments pour comprendre les effets synergiques

Par exemple:

X1	X2	X3	Y
100	100	dix	5
50	50	5	25
200	200	0	dix
100	100	0	30
200	0	dix	3
100	0	5	20
0	200	dix	1
0	100	5	8
0	0	0	60

Existe-t-il un moyen de faire Fit Y avec trois médicaments différents X1, X2 et X3 sur JMP ?

Au départ, j'ai exécuté Fit Model et créé des profileurs de prédiction, mais les valeurs de prédiction sont très éloignées des valeurs observées.

I appliqué le Logit/LogitPct/et toutes les autres transformations à la réponse Y dans la boîte de dialogue de lancement Ajuster le modèle, mais les valeurs de prédiction ne sont pas proches des valeurs observées.

Existe-t-il un moyen d'analyser Y en réponse aux X factoriels ?

Exploration et visualisation des donnéesRe : Comment faire Ajuster Y par X si je veux faire pour les X factoriels

Une autre idée consiste à utiliser une analyse probit avec JMP. Vous mesurez la survie des cellules, donc si vous connaissez le nombre de cellules au début et le nombre encore en vie à la fin, vous pouvez utiliser le prédicteur linéaire avec ces décomptes.

 

Je n'ai pas d'exemple comme vos données, mais je peux illustrer avec la table de données Ingots2 dans le dossier JMP Sample Data. Voici le tableau de données :

 

 

Nous avons le nombre de ces lingots qui sont prêts, pas prêts et le total. Ceci est analogue à vos cellules qui sont vivantes, mortes et totales. Ensuite, nous ouvrons la boîte de dialogue Ajuster le modèle et apportons ces modifications :

 

 

Le modèle initial inclut les deux facteurs et leur interaction. Vos facteurs seraient plutôt les médicaments. Les résultats de ce modèle montrent que l'interaction ici n'est pas significative.

 

 

Les termes non significatifs sont supprimés et le modèle réduit (dans ce cas) ne comporte qu'un seul facteur.

 

 

Nous pouvons voir qu'à mesure que le niveau de facteur augmente, la proportion de non prêts augmente également. Vous pouvez également utiliser un profileur avec ce modèle.

Re : Comment faire Ajuster Y par X si je veux faire pour les X factoriels

Je ne sais pas pourquoi vous ne pouvez pas utiliser Fit Les moindres carrés. J'ai aussi capturé votre exemple comme @statman et analysé vos données de cette façon. J'obtiens un modèle raisonnable. Le facteur X1 semble n'avoir aucun effet. Le X2 et le X3 ont tous deux des effets et une interaction, c'est ce que vous vouliez savoir. Voici le tracé réel par prédit, qui présente un accord raisonnablement bon entre les observations que vous avez publiées et le modèle réduit que j'ai utilisé.

 

Re : Comment faire Ajuster Y par X si je veux faire pour les X factoriels

Salut @joepark ,

 

En utilisant votre exemple de table de données, vous pouvez faire toutes sortes d'ajustements Y par modèles. Vous pouvez les faire individuellement à l'aide de la plate-forme Ajuster Y par X, puis effectuer un ajustement linéaire (ou non linéaire) pour chacun des Y par X1, Y par X2 et Y par X3. Vous pouvez basculer très facilement d'avant en arrière en utilisant le sélecteur de colonne. Accédez au bouton rouge à côté de l'ajustement bivarié> Rétablir> Commutateur de colonne. Sélectionnez ensuite X1 dans le panneau supérieur et tous les autres X dans le panneau inférieur, puis appuyez sur OK. Cela devrait répondre à votre première question, mais ne répondra pas aux effets synergiques.

 

Je ne suis pas sûr de bien suivre votre question sur la façon d'analyser Y en tant que réponse aux X factoriels. Votre DOE était-il initialement basé sur un plan factoriel ? Si vous essayez de faire un modèle ajusté et que les effets du modèle soient définis par une factorielle complète, après avoir lancé la plate-forme et sélectionné X1 à X3, cliquez sur l'option Macros et sélectionnez la factorielle complète. Ensuite, vous pouvez réduire les effets du modèle pour obtenir un ajustement raisonnable. Prenez note des effets qui ont le carat "^" à côté d'eux. Cela signifie que les termes d'ordre supérieur (ceux contenant des choses comme X1*X1 ou X1*X2 apparaîtraient avant l'effet d'ordre principal comme X1. À l'aide de votre tableau de données, il suggère que X1 n'est pas un facteur significatif et souhaite le supprimer de l'ajustement. Vous auriez besoin d'évaluer si cela a du sens ou non.

 

Vous devrez peut-être étendre votre DOE ou exécuter des répliques afin de réduire le bruit dans votre système. Le profileur de prédiction est utile, mais le plus important est de savoir si votre modèle d'ajustement et vos données se situent toujours dans l'intervalle de confiance de +/- 95 %. Vous pouvez y accéder à partir du bouton rouge et les enregistrer sous forme de colonnes. Dans le cas de test que j'ai fait, toutes les données (Y et valeurs de prédiction) relèvent de ces CI. Vous devrez peut-être repenser votre modèle pour vous assurer qu'il est suffisamment précis.

 

J'espère que cela t'aides,

DS

Re : Comment faire Ajuster Y par X si je veux faire pour les X factoriels

Bonjour statman,

Merci pour la réponse. Malheureusement, je ne suis pas autorisé à partager des données sans autorisation.

Mes excuses pour le manque de suppléments.

 

J'analyse les effets synergiques de plusieurs médicaments.

Ma première approche était le modèle Fit, puis les profileurs de prédiction. Ensuite, j'ai trouvé que les valeurs de prédiction sont très éloignées des valeurs expérimentales.

Hier, j'ai posé des questions à ce sujet et j'ai obtenu d'excellents retours (transformer les réponses à la boîte de dialogue du modèle Logit in Fit)

Après transformation des réponses, les profileurs de prédiction sont plus proches des valeurs expérimentales, mais ce n'est pas assez proche.

Voici mon message original pour la référence ( https://community.jmp.com/t5/Discussions/Prediction-profiler-prediction-values-do-not-match-with-the/mp/449473#M69631 )

 

Je me demande si je peux faire Fit Y by X. Dans mon cas, j'ai 3 facteurs (X) et une réponse (Y). Chaque X a une plage de concentration différente.

Donc, comme factoriel complet, je veux faire

Ajuster Y par X1*X2

X1*X3

X2*X3

X1*X2*X3

Est-il possible de le faire sur JMP ?

 

Re : Comment faire Ajuster Y par X si je veux faire pour les X factoriels

Jo,

Il est utile d'ajouter simplement le fichier JMP.

J'ai créé la table de données dans JMP et créé un modèle d'ajustement (commencé avec un modèle saturé, puis réduit). J'ai enregistré la formule de prédiction dans le tableau de données (ci-joint)

 

Je n'ai aucune idée de ce que vous expérimentez, si vos données ont une valeur pratique ou si les résultats ont un sens scientifique si difficile à fournir des conseils.