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JMP > JSL > Wie übergebe ich Argumente an ein Add-In, das mein eigenes Skript enthält?

Hallo JMP-Community,

 

Ich bin ein begeisterter Benutzer des FDR-Berechnungs-Add-Ins von John Sall ( com.sas.sall.fdrpvalue.jmpaddin) bei der Analyse großer Biomarkerdaten.

Während die manuelle Eingabe von Daten in diesem Add-In unkompliziert ist, habe ich noch nicht herausgefunden, wie ich Argumente aus meinen JSL-Skripten an dieses Tool übergeben kann.

 

Ich weiß, dass ich den Befehl „Einschließen“ („[Add-in]“) verwenden muss, um die Verwendung des Add-Ins in meinen Skripten zu aktivieren, aber wie verweise ich im Add-In auf bestimmte von meinem Skript generierte Spalten?

 

Ich danke Ihnen für Ihre Hilfe.

 

Am besten,

TS

Automatisierung und SkripterstellungBetreff: JMP > JSL > Wie übergebe ich Argumente an ein Add-In, das mein eigenes Skript enthält?

Hallo JMP-Community,

 

Zunächst einmal vielen Dank an @jthi für eine schnelle und effiziente Lösung.

Der Vollständigkeit halber habe ich eine grobe Alternativoption verwendet, bei der ich eine Funktion aus den Kernelementen des FDR-JSL-Skripts erstellt habe (siehe unten). Diese Funktion habe ich dann in meinem Skript aufgerufen.

WICHTIG: Der in dieser Funktion verwendete Kerncode wurde von John Sall erstellt.

NamesDefaultToHere(1);

fdr = Function ({dtf, pvalCol},

 pvalues = pvalCol<<GET values="">1,dialog("PValues must be between 0 and 1");throw());

 index = rankIndex(pvalues); // removes missing values
 n = nrow(index);

 ordPValue = pvalues[index];
 adjPValue = J(n,1,.);

 for(i=1,i<=n,i++,
  j = n-i+1;
  ratio = n/(n-i+1);
  adjPValue[j] = if (i==1,ordPValue[j],min(ratio*ordPValue[j],adjPValue[j+1]));
 );
 
 rowPValues = J(NRow(dtf),1,.);
 rowPValues[index] = adjPValue;
 sfx = pvalCol << get name ();
 n_col_name = "FDR " || sfx;
 dtf<<NEWCOLUMN></NEWCOLUMN></GET>

Am besten ,

 

TS

Betreff: JMP > JSL > Wie übergebe ich Argumente an ein Add-In, das mein eigenes Skript enthält?

Ich habe das Add-In von installiert Hier und schaute mir den Code an. Ich würde es höchstwahrscheinlich umschreiben und Funktionen verwenden, aber Sie sollten in der Lage sein, das neue Fenster, das das Add-In erstellt, mit etwas wie diesem zu verwenden:

Names Default To Here(1);

//This will immediately launch New Window with reference fdrDlg
Include("$ADDIN_HOME(com.sas.sall.fdrpvalue)/falseDiscoveryPValue.jsl");

dt = Open("$SAMPLE_DATA/Big Class.jmp");
colListLabel << Set Items({"age", "sex"}); //Label Columns
colListPVal << Set Items({"height"}); //PValue Column

//ok button doesn't have direct reference, so we can look for it with XPath for example
ok_btn = (fdrDlg << XPath("//ButtonBox[@title='OK']"))[1];

//to launch we can press ok_btn
ok_btn << Click;