JMP > Riduzione dimensione > Comprimi variabili altamente correlate (totale N = 7300)?Ciao comunità JMP,
Ho un ampio set di dati di biomarcatori (7.300 variabili) che contiene più sottoinsiemi di variabili altamente correlate (r> 0,95) che voglio comprimere in variabili rappresentative (cioè una variabile aggregata per ogni gruppo di variabili altamente correlate). Mentre posso facilmente identificare le coppie di variabili altamente correlate, sto lottando con l'identificazione di tutti i membri di ciascun gruppo. Ho sperimentato il Clustering, ma non riesco a ottenere una risposta definitiva.
Esiste un metodo nei metodi MultiVariate che mi consentirebbe di comprimere questo set di dati?
Da notare che non posso gestire il set di dati a causa della riservatezza.
Grazie per l'aiuto.
Migliore,
TS
AnalisiRe: JMP > Riduzione dimensione > Comprimi variabili altamente correlate (totale N = 7300)?Ciao comunità JMP,
Sembra che tendo a trovare parte della risposta subito dopo la pubblicazione. Passaggio 1: utilizzare la piattaforma Clustering variabile nel menu Custer = completato.
Ora che ho a disposizione le variabili raggruppate con i risultati Most Representative e Cluster Membership, qual è il modo migliore per applicare l'output alla mia tabella (presumo che lo script JSL sarà coinvolto).
Grazie per l'aiuto.
Migliore,
TS
Re: JMP > Riduzione dimensione > Comprimi variabili altamente correlate (totale N = 7300)?Ciao comunità JMP,
Bene, ho risolto la mia domanda. Dopo aver raggruppato le variabili (il sottoinsieme di variabili con intercorrelazione > 0,95), ho abbinato l'appartenenza al cluster e il più rappresentativo all'originale STACKED (tabella alta x stretta). Ho quindi selezionato tutte le righe senza associazione a un cluster e quelle con un nome corrispondente al nome più rappresentativo, sottoinsieme e diviso per variabile. Sono passato da 7.300 variabili a 5.700 (cioè collasso del 22%).
Migliore,
TS
