JMP > Réduction des dimensions > Réduire les variables hautement corrélées (N total = 7 300) ?Salut la communauté JMP,
J'ai un vaste ensemble de données de biomarqueurs (7 300 variables) qui contient plusieurs sous-ensembles de variables hautement corrélées (r> 0,95) que je souhaite regrouper en variables représentatives (c'est-à-dire une variable agrégée pour chaque groupe de variables hautement corrélées). Bien que je puisse facilement identifier les paires de variables hautement corrélées, j'ai du mal à identifier tous les membres de chaque groupe. J'ai expérimenté le clustering, mais je ne peux pas obtenir de réponse définitive.
Existe-t-il une méthode dans les méthodes multivariées qui me permettrait de réduire cet ensemble de données ?
Il convient de noter que je ne peux pas partager l'ensemble de données en raison de la confidentialité.
Merci de votre aide.
Meilleur,
TS
AnalytiqueRe : JMP > Réduction des dimensions > Réduire les variables hautement corrélées (N total = 7 300) ?Une autre pensée pour vous en plus du clustering est l'analyse des composantes principales. Conçu sur mesure pour la réduction de la dimensionnalité.
Re : JMP > Réduction des dimensions > Réduire les variables hautement corrélées (N total = 7 300) ?Salut la communauté JMP,
Bon, j'ai résolu ma question. Après avoir regroupé les variables (le sous-ensemble de variables avec intercorrélation> 0,95), j'ai fait correspondre l'appartenance au cluster et le plus représentatif à l'original STACKED (tableau haut x étroit). J'ai ensuite sélectionné toutes les lignes sans association avec un cluster et celles dont le nom correspond au nom le plus représentatif, sous-ensemble et divisé par variable. Je suis passé de 7 300 variables à 5 700 (soit 22 % d'effondrement).
Meilleur,
TS
Re : JMP > Réduction des dimensions > Réduire les variables hautement corrélées (N total = 7 300) ?Salut la communauté JMP,
Il semble que j'ai tendance à trouver une partie de la réponse peu de temps après avoir posté. Étape 1 : Utilisez la plate-forme Variable Clustering sous le menu Custer = terminé.
Maintenant que j'ai les variables regroupées avec les résultats les plus représentatifs et les membres de cluster disponibles, quelle est la meilleure façon d'appliquer la sortie à ma table (je suppose que le script JSL sera impliqué).
Merci de votre aide.
Meilleur,
TS
