JMPゲノミクス-階層的クラスタリングのサンプル順序Basic RNA-SeqワークフローのANOVA出力の下で、JMP Genomicsは、サンプルサンプル（列）と有意に差次的に発現する遺伝子（行）の両方の階層的クラスタリングを作成します。 しかし、遺伝子だけをクラスター化する方法はありますか？ 時系列データセットがありますが、プレゼンテーションのために、調査時点ごとに列を配置したいと思います。 これを達成する方法が見つかりません。 前もって感謝します！
グラフィックスウィンドウズRe：JMPGenomics-階層的クラスタリングのサンプル順序こんにちは@LouisAltamura 、
Genesでのみクラスター化し、サンプルでクラスター化せずにカラーマップを表示できますが、クラスター化後に列の順序を変更することはできません。 それらは、階層的クラスタリングダイアログに配置された順序で並べ替えられます。 遺伝子もこれらの列に基づいてクラスター化されるため、列を変更して再度クラスター化を試みると、クラスター化が変更されます。
遺伝子の階層ツリーを維持したいようですが、別の列のセットを使用してヒートマップを作成し、それらの列情報（この場合は時系列）に基づいて列を並べ替えます。 そうでない場合は、列をクラスタリングせずに、ヒートマップ内の列を表す時系列に従って列を再配置するように求めていますか（双方向クラスタリング？）。
たとえば、以下の3つのサンプル（列）のクラスタリングを削除し、時系列（DOM、CAS、MUSなど）を表すように順序を再配置することを検討していますか？
Re：JMPGenomics-階層的クラスタリングのサンプル順序はい、遺伝子のクラスター化を維持したいのですが、サンプルを時点別に並べ替えるだけです。 サンプルによるクラスタリングは必要ありません。
デフォルトの階層的クラスタリンググラフは、このプレゼンテーションに必要のない多くの列を追加することになります。 そのため、分析を再開し、必要なStdLSMeans列のみを選択しています。 残念ながら、このプロセスでは、デフォルトでは、列を入力した順序でヒートマップが表示されません。 双方向クラスタリングを実行した場合にのみ、ヒートマップを表示できます。
