Al utilizar el flujo de trabajo básico de ARN-Seq en JMP Genomics, ¿cómo se define la significancia?
Aunque he especificado el ajuste del valor p de FDR, los gráficos de volcanes aún grafican los valores p sin ajustar en el eje y. Hablando de gráficos de volcanes, ¿cómo se determina la línea horizontal? Este valor parece fluctuar entre experimentos, pero no puedo encontrar ninguna indicación de lo que representa.
En Datos de salida, no queda claro si los resultados de ANOVA se filtran según el valor p bruto o los valores p ajustados.