JMP Genomics - 基本 RNA 测序工作流程的 P 值标准在使用 JMP Genomics 中的基本 RNA-Seq 工作流时，如何定义重要性？
尽管我已指定 FDR p 值调整，但火山图仍会在 y 轴上绘制未调整的 p 值。说到火山图，水平线是如何确定的？这个值似乎在实验之间波动，但我找不到任何迹象表明它代表什么。
在输出数据下，不清楚方差分析结果是根据原始 p 值还是调整后的 p 值进行过滤的。
分享和交流结果视窗回复：JMP Genomics - 基本 RNA-Seq 工作流程的 P 值标准谢谢@路易斯阿尔塔穆拉,
有更新到 10.0. 这是一个修补程序，可以将您的版本升级到 10.1。 你可以在这里查看：
https://www.jmp.com/support/notes/67/654.html
很高兴我能帮上忙，
回复：JMP Genomics - 基本 RNA-Seq 工作流程的 P 值标准谢谢克里斯！ 我仍在使用 10.0 版，帮助对话框指向较旧的资源。 这份 10.1 的新用户指南似乎更加清晰。
回复：JMP Genomics - 基本 RNA-Seq 工作流程的 P 值标准你好@路易斯阿尔塔穆拉,
未经调整的 -log10(p 值) 绘制在火山图的 y 轴上。 绘制的水平线是在基本 RNA-Seq 工作流程对话框中定义的调整（在本例中为 FDR 调整）p 值截止值（参见下图中的多重测试部分）。 此截止值用于过滤转录本，因此保留原始 -log10(p 值) 大于或等于此 FDR 调整截止值的任何转录本，其余的被过滤掉。
以下是有关方差分析结果报告输出的更多详细信息的联机帮助：
https://www.jmp.com/support/downloads/JMPG101_documentation/Content/JMPGUserGuide/OT_G_EX_0021.htm#expression2_625941553_431746
希望这可以帮助，
