僅針對某些變量在混合效應模型中缺少輸出你好，
我試圖模擬金屬離子對蚯蚓不同代謝物的影響——即這是一個環境污染問題。 我有許多不同金屬離子的濃度值，以及許多不同代謝物的濃度值，都基於每隻蠕蟲（個體）。
由於蠕蟲是從許多不同的地點收集的，並且在地點內有明顯的聚類 - 無論是代謝物相似性還是金屬離子濃度（這一點並不奇怪，因為一些這些地點是專門採樣的，因為它們被污染了）。
我試圖將代謝物的影響建模為混合效應模型，使用“擬合模型”菜單，將“金屬”作為固定效應，將“部位”和“部位 x 金屬”作為隨機效應（“金屬”和“代謝物”） " 是連續變量，"site" 是分類變量）。
現在，這是我的問題。 對於某些代謝物，JMP 輸出給出了我正在尋找的結果，金屬離子對代謝物濃度影響的顯著性檢驗（“固定效應檢驗”），但對於其他一些代謝物，它不計算值，只是給出“。”關於發生了什麼的任何建議？ 沒有缺失值，所以樣本和變量的數量是相同的——只是它給了我一些因變量的答案，而不是其他的。
謝謝你...
分析回复：僅針對某些變量在混合效應模型中缺少輸出您可以將數據表作為附件或屏幕截圖共享嗎？
能否也分享一下JMP平台（如圖）？ 可能是您以混淆某些效果的方式指定了模型。
這些站點是否充當阻塞因素，具有隨機效應？ 這種解釋是您所說的“站點內清晰的聚類”嗎？
回复：僅針對某些變量在混合效應模型中缺少輸出您可以將數據表作為附件或屏幕截圖共享嗎？
我將上傳一個縮減版本 - 它與原始文件相同，但我剛剛刪除了幾乎所有的變量，只留下足以代表兩次比較的內容。
（注意兩個樣本，第 21 行和第 22 行，被排除在分析之外。）
能否也分享一下JMP平台（如圖）？ 可能是您以混淆某些效果的方式指定了模型。
是的，我會試一試，謝謝 - 希望這就是你的意思，所選相關選項的屏幕截圖？
注意，對我來說，顯示的兩個 Y 變量具有不同的結果，因為 JMP 成功地計算了一個的 P 值，而不是另一個。
這些站點是否充當阻塞因素，具有隨機效應？ 這種解釋是您所說的“站點內清晰的聚類”嗎？
這不是專門設計的田間試驗——這些是來自土著居民的蠕蟲，我們已經去那裡挖掘了它們。 （為了更全面的參考：我們確實將站點分類為“控制”和“預測”，我也很想嘗試對這種分類進行建模，但對於當前的問題，我正在嘗試對潛在污染物（金屬離子）基於每個蠕蟲，而不是基於每個站點。）無論您是根據金屬離子還是蠕蟲代謝物濃度進行分類，這些站點都非常不同 - 例如，通過多變量方法（如 PCA）清晰地可視化。 我絕對不認為自己是使用混合效應模型的專家——我在這裡的方法是基於與同事的討論，如果我發現我正在嘗試做一些不合理的事情，我不會感到震驚。 注意他們的評論之一是分配隨機效應僅對分類變量真正有意義，但 JMP 確實允許將隨機效應分配給連續變量：我應該假設這不是一個好主意嗎？
總而言之，我可以得到一個有效的答案，使用 PCA 和 PLS 建模（基於站點的交叉驗證保留集，使用與 JMP 不同的包 - 也許我應該考慮某種單變量重採樣方法分析？？），但我真的很想能夠得到單變量情況的答案。原因有以下三個：
- 我希望能夠在多變量分析的同時進行單變量分析。
- 即使我主要介紹多變量分析，能夠提取關鍵變量作為潛在的生物標誌物並更詳細地分析這些也非常有用。
- 我希望能夠了解發生了什麼！
非常感謝 ...
